结论：税务局要求个人补税，公司代扣是否合法需分情况讨论，具体如下：

1. 若公司作为扣缴义务人，且代扣行为符合法定程序和条件，则合法
   根据《中华人民共和国税收征收管理法》及《个人所得税法》相关规定，公司作为支付所得的单位，通常负有代扣代缴个人所得税的法定义务。若税务局发现个人存在少缴、漏缴税款的情况，并通知公司代扣补缴税款，公司按照税务局的要求，在核实应补税金额后，从个人后续收入中代扣并补缴至税务机关，且代扣过程遵循法定程序（如告知个人补税依据、金额及申诉渠道等），则该代扣行为合法。

2. 若公司代扣行为存在以下情形，则可能不合法：

   • 未履行告知义务：公司在代扣前未向个人明确说明补税的原因、金额及法律依据，导致个人对补税事项不知情或存在异议。
     
   • 代扣金额错误：公司计算的应补税金额与税务局核定的金额不符，或存在计算错误、重复扣缴等情况。
     
   • 超出法定权限：公司未经税务局正式通知或授权，擅自决定代扣个人税款，或代扣的税款种类、范围超出法定范围。
     
   • 侵犯个人权益：公司以代扣税款为由，非法限制个人的人身自由、财产权益或其他合法权益。

建议：

• 若您遇到公司代扣补税的情况，首先应要求公司出示税务局的正式通知或相关文件，核实补税的合法性和金额。
  
• 若您对补税事项存在异议，可向公司提出书面申诉，并要求公司协助向税务局申请复核或听证。
  
• 若公司代扣行为存在违法情形，您可向当地税务机关举报或投诉，并依法维护自己的合法权益。
  

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