针对员工明目张胆违反按时上班纪律的问题，企业应首先依据内部规章制度进行处理，同时需确保处理程序合法合规，避免引发劳动争议。以下从不同角度展开说明：

1. 依据规章制度处理
   企业应首先检查内部《员工手册》或《考勤管理制度》中是否明确规定了上下班时间、迟到早退的处罚措施（如警告、扣薪、解除合同等），以及制度的民主公示程序（如经职工代表大会讨论、公示等）。若制度合法有效且员工已知悉，企业可依据制度对违规员工进行处罚，但需注意：

   • 处罚需与违规情节匹配（如首次迟到可警告，多次迟到可扣薪，严重旷工可解除合同）；
     
   • 处罚需留存书面记录（如签收警告单、扣薪通知等），避免口头处理。

2. 合法解除劳动合同的情形
   若员工行为构成“严重违反规章制度”，企业可依据《劳动合同法》第39条解除合同，但需满足：

   • 制度中明确将“多次迟到早退”“旷工X日”等列为“严重违纪”；
     
   • 员工违规行为达到制度规定的标准（如连续旷工3天或一年内累计旷工5天）；
     
   • 解除前履行法定程序（如通知工会、送达解除通知等）。
     风险提示：若制度未明确“严重违纪”标准，或企业未留存员工违规证据（如考勤记录、监控录像等），解除合同可能被认定为违法，需支付赔偿金。

3. 非解除合同的处理方式
   若员工违规情节较轻，企业可优先选择以下方式：

   • 扣减绩效/奖金：在制度中明确考勤与绩效挂钩，按比例扣减；
     
   • 调岗或培训：对长期迟到但工作能力尚可的员工，可调整至考勤要求较低的岗位或进行时间管理培训；
     
   • 协商解除：与员工沟通，协商一致后支付经济补偿解除合同，避免纠纷。

4. 预防与证据留存
   为避免后续争议，企业需：

   • 完善考勤制度（如采用指纹/人脸打卡、定期公示考勤记录）；
     
   • 对违规行为及时处理并留存证据（如员工签字的警告单、考勤表、监控录像等）；
     
   • 定期组织员工学习制度，确保其知悉规定。

总结建议：企业应先依据合法有效的制度处理，优先通过扣薪、警告等方式纠正行为；若员工拒不改正且达到“严重违纪”标准，再依法解除合同。处理过程中需注重程序合法性和证据留存，必要时可向我进一步咨询具体操作细节。