结论：非法吸收公众存款罪中员工的投资款是否可以核减，需根据具体情况判断，主要包括员工是否知情、投资款性质及司法实践中的处理方式等因素。以下从不同角度详细分析：
一、员工是否知情对投资款核减的影响
员工不知情的情况：
- 如果员工在投资时并不知晓公司存在非法吸收公众存款的行为，且其投资行为是基于对公司的信任或正常的商业判断，那么其投资款在法律上可能被视为善意取得。
- 在这种情况下，员工的投资款通常不会被直接核减为犯罪所得，而是可能作为民事纠纷处理，员工有权通过民事途径追讨其投资款。
员工知情的情况：
- 如果员工明知公司存在非法吸收公众存款的行为，仍然选择投资，那么其投资行为可能被视为对犯罪行为的参与或支持。
- 在这种情况下，员工的投资款可能会被认定为犯罪所得的一部分，从而在刑事判决中被核减或追缴。
二、投资款性质对核减的影响
投资款作为犯罪工具：
- 如果投资款被直接用于非法吸收公众存款的犯罪活动，如支付高额利息、吸引更多投资者等，那么这些投资款很可能被视为犯罪工具。
- 在这种情况下，投资款可能会被依法追缴或没收，作为对犯罪行为的惩罚和补偿。
投资款作为个人财产：
- 如果投资款是员工个人的合法财产，且并未直接用于犯罪活动，而是作为正常的投资行为，那么这些投资款在法律上应受到保护。
- 然而，在非法吸收公众存款罪的语境下，即使投资款是员工个人的合法财产，也可能因公司犯罪行为而受到牵连，具体处理需根据司法实践和判决情况而定。
三、司法实践中的处理方式
区分处理原则：
- 在司法实践中，法院通常会根据员工的知情程度、投资款性质以及公司在犯罪中的作用等因素，对员工的投资款进行区分处理。
- 对于不知情的员工，其投资款可能得到一定程度的保护；对于知情的员工，其投资款则可能面临被追缴或没收的风险。
具体案例参考：
- 在实际案例中，法院可能会根据具体情况判决员工的投资款是否应被核减。例如，如果员工能够证明其投资行为是基于对公司的信任且不知情，法院可能会判决其投资款不受影响；反之，如果员工明知公司犯罪仍投资，法院则可能判决其投资款被追缴。
四、法律建议
对于员工而言：
- 在投资前应充分了解公司的经营状况和法律风险，避免盲目投资。
- 如果发现公司存在非法吸收公众存款等违法行为，应立即停止投资并报警，以保护自己的合法权益。
对于公司而言：
- 应遵守法律法规，不得从事非法吸收公众存款等违法行为。
- 如果公司涉及此类犯罪，应积极配合司法机关的调查和处理工作，以减轻法律后果。
总结：非法吸收公众存款罪中员工的投资款是否可以核减，需根据员工是否知情、投资款性质及司法实践中的处理方式等因素综合判断。如果您或您身边的人遇到此类问题，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供更详细的法律建议。