为确保员工离职能追回通过公司领取的补贴，公司可采取以下措施：

1. 完善劳动合同与规章制度：

   • 在劳动合同中明确约定补贴的性质、发放条件、发放方式以及离职后的处理方式。例如，可以约定补贴为公司对员工的特殊福利，员工离职时需按比例返还或全额返还（根据补贴性质及公司政策决定）。
   • 制定并完善公司规章制度，对补贴的发放、管理、追回等作出详细规定，并确保这些制度经过民主程序制定且已向员工公示或告知。

2. 签订专项协议：

   • 对于特定类型的补贴（如住房补贴、交通补贴等），可以与员工签订专项协议，明确补贴的发放期限、条件及离职后的返还义务。专项协议应详细列明补贴的具体金额、发放方式、返还条件及违约责任等。

3. 保留相关证据：

   • 公司应妥善保存与补贴发放相关的所有证据，包括但不限于补贴申请表、审批流程记录、发放凭证（如银行转账记录）、员工签字确认的补贴领取单等。这些证据在员工离职后追回补贴时将起到关键作用。

4. 及时沟通与协商：

   • 在员工离职时，公司应主动与员工沟通补贴的返还事宜，明确告知员工其返还义务及法律后果。通过协商的方式解决补贴返还问题，可以减少不必要的法律纠纷。

5. 依法追回：

   • 如果员工拒绝返还补贴，公司可以依据劳动合同、规章制度或专项协议中的约定，通过法律途径追回补贴。这可能包括向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼等。在追回过程中，公司应确保自己的诉求有充分的法律依据和证据支持。

6. 注意诉讼时效：

   • 公司应注意诉讼时效的问题，确保在法定的诉讼时效期间内提起仲裁或诉讼。一般来说，劳动争议的诉讼时效期间为一年，自员工知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。

7. 考虑税务因素：

   • 在追回补贴时，公司还应考虑税务因素。如果补贴在发放时已经作为员工的应税收入进行了税务处理，那么在追回时可能需要与税务机关进行沟通，确保税务处理的合规性。