结论：在法定代表人是诉讼中的第三人时，其是否还能代表公司应诉，需根据具体情况来判断。一般来说，如果法定代表人作为第三人参与诉讼的事项与其代表公司应诉的事项不冲突，且法院未对其代表权进行限制，那么法定代表人仍然可以代表公司应诉；但如果存在冲突或法院限制，则可能不能代表公司应诉。
分析说明：
法定代表人的基本职责：
- 法定代表人作为公司的法律代表，有权代表公司进行各种法律行为，包括参与诉讼。这是法定代表人的一项基本职责，也是公司法律制度的重要组成部分。
第三人参与诉讼的情况：
- 当法定代表人作为第三人参与诉讼时，这通常意味着该法定代表人在该诉讼中具有独立的法律地位，可能涉及与公司的利益相关但并非直接代表公司的事项。例如，法定代表人可能因个人行为或与公司无关的事务被卷入诉讼。
代表公司应诉的条件：
- 无冲突原则：如果法定代表人作为第三人参与诉讼的事项与其代表公司应诉的事项不冲突，即两者不涉及同一法律关系或同一事实争议，那么法定代表人仍然可以代表公司应诉。
- 法院未限制：法院在审理案件时，如果未对法定代表人的代表权进行限制，那么法定代表人仍然有权代表公司进行诉讼活动。
可能不能代表公司应诉的情况：
- 存在冲突：如果法定代表人作为第三人参与诉讼的事项与其代表公司应诉的事项存在冲突，例如两者涉及同一法律关系或同一事实争议，那么法院可能会限制法定代表人的代表权，以避免利益冲突和混淆。
- 法院限制：在某些情况下，法院可能会根据案件的具体情况和法律原则，对法定代表人的代表权进行限制。例如，如果法定代表人存在违法行为或严重失职行为，法院可能会剥夺其代表公司应诉的权利。
法律建议：
- 如果公司面临诉讼，且法定代表人同时作为第三人参与诉讼，公司应首先评估两者之间是否存在冲突，以及法院是否可能对法定代表人的代表权进行限制。
- 如果存在冲突或法院限制的可能性，公司应考虑委派其他合适的代表（如公司高管、律师等）参与诉讼，以确保公司的合法权益得到充分保护。
- 在任何情况下，公司都应积极配合法院的审理工作，提供必要的证据和材料，以维护公司的合法权益。
后续行动与思考：
- 公司应建立健全的诉讼应对机制，明确在不同情况下应如何委派代表参与诉讼，以确保公司的法律事务得到妥善处理。
- 公司应加强对法定代表人的法律培训和监督，提高其法律意识和风险防范能力，避免因法定代表人的个人行为或失职行为给公司带来不必要的法律风险。
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