在医保诈骗案件中，关于退赃数额是否要减去扣押的药品，这并非一个简单的“是”或“否”的问题，而是需要根据具体的案件情况和法律规定来综合判断。

首先，我们要明确的是，医保诈骗案件中的退赃，是指犯罪嫌疑人或被告人将其非法获取的医保基金或相关财物退还给医保部门或相关机构的行为。这是犯罪嫌疑人或被告人承担刑事责任、减轻处罚或争取从宽处理的重要方式之一。

接下来，我们分析扣押的药品在退赃中的地位。扣押的药品，通常是公安机关在侦查过程中，根据案件需要，对涉嫌犯罪的财物进行扣押的。这些药品可能是犯罪嫌疑人或被告人用于诈骗的直接证据，也可能是其非法获取的财物的一部分。

1. 如果扣押的药品是犯罪嫌疑人或被告人非法获取的医保基金直接购买的：

   • 在这种情况下，扣押的药品实际上就是医保基金的转化形式。因此，在退赃时，这些药品的价值应当计入退赃数额中。也就是说，犯罪嫌疑人或被告人需要退还的不仅仅是现金形式的医保基金，还包括这些药品的价值。

2. 如果扣押的药品并非直接由医保基金购买，但与诈骗行为有关：

   • 在这种情况下，扣押的药品可能作为证据使用，以证明犯罪嫌疑人或被告人的诈骗行为。然而，在退赃时，是否要将这些药品的价值计入退赃数额，则需要根据具体情况和法律规定来判断。如果药品本身并非非法所得，但因其与诈骗行为有关而被扣押，那么在退赃时可能不需要直接减去其价值，但可以作为量刑情节考虑。

3. 法律程序和实际操作：

   • 在实际操作中，退赃数额的确定通常需要经过医保部门、公安机关和检察机关的共同确认。医保部门会提供被骗取的医保基金的具体数额和相关证据；公安机关会提供扣押的财物清单和价值评估；检察机关则会根据法律规定和案件情况，对退赃数额进行最终确认。
   • 如果犯罪嫌疑人或被告人对退赃数额有异议，他们可以通过法律途径提出申诉或辩护，由法院进行最终裁决。

举例说明： 假设某医保诈骗案件中，犯罪嫌疑人通过虚假报销骗取了10万元的医保基金，并用其中的一部分购买了价值2万元的药品。后来，这些药品被公安机关扣押。在退赃时，犯罪嫌疑人需要退还的不仅仅是剩余的8万元现金，还包括这2万元药品的价值（如果药品尚未被使用或销售）。因为这2万元药品实际上是医保基金的转化形式，应当计入退赃数额中。

综上所述，医保诈骗案件中的退赃数额是否要减去扣押的药品，需要根据具体情况和法律规定来判断。在大多数情况下，如果扣押的药品是非法获取的医保基金的直接转化形式，那么其价值应当计入退赃数额中。