结论：在林地纠纷未解决的情况下，您擅自种植桉树，若对方起诉要求清除障碍，您可能面临法律责任。具体责任及应对措施需根据纠纷性质、土地权属及您的行为情况综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律责任分析
侵权责任：
- 若林地权属存在争议，在权属未明确前，您擅自种植桉树可能构成对对方土地使用权的侵害。根据《民法典》相关规定，侵害物权造成权利人损害的，权利人可以依法请求损害赔偿，也可以依法请求承担其他民事责任。对方有权要求您停止侵害、排除妨碍（即清除桉树）并赔偿损失。
行政责任：
- 若您的行为违反了土地管理、林业管理等相关法律法规，如未经批准擅自改变林地用途，可能面临林业主管部门的行政处罚，包括罚款、责令恢复原状等。
二、应对措施建议
立即停止行为：
- 在纠纷解决前，建议您立即停止在争议林地上的种植行为，避免损失进一步扩大。
收集证据：
- 收集与林地权属、种植行为相关的证据，如土地证、承包合同、种植记录、照片等，以证明您的行为合法性或减轻责任。
协商解决：
- 尝试与对方进行协商，寻求和解或达成临时协议，如共同委托第三方进行权属鉴定，或约定在纠纷解决前保持现状等。
法律途径：
- 若协商无果，您应积极应诉，向法院提供证据证明您的行为合法或对方主张不成立。同时，您也可以主动提起确认权属之诉，请求法院明确林地权属，从根本上解决纠纷。
三、特殊情况考虑
若您拥有合法权属：
- 若您能证明对争议林地拥有合法权属（如土地证、承包合同等），则您的种植行为不构成侵权，对方无权要求您清除障碍。此时，您应积极提供证据，维护自己的合法权益。
若对方行为违法：
- 若对方在纠纷解决过程中存在违法行为（如破坏您的种植作物、威胁恐吓等），您应及时报警并保留证据，以便在后续法律程序中主张自己的权利。
最后提醒：林地纠纷涉及复杂的法律关系和权属问题，建议您在处理过程中保持冷静、理性，避免采取过激行为。如有需要，您可以随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。