企业未批先建的处罚主管部门主要是生态环境主管部门。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律依据与主管部门：

   • 根据《中华人民共和国环境影响评价法》的相关规定，建设单位在建设项目开工前，应当依法进行环境影响评价，并报有审批权的环境保护行政主管部门审批。若企业未依法报批建设项目环境影响报告书、报告表，或者未依照本法第二十四条的规定重新报批或者报请重新审核环境影响报告书、报告表，擅自开工建设的，由县级以上生态环境主管部门责令停止建设，根据违法情节和危害后果，处建设项目总投资额百分之一以上百分之五以下的罚款，并可以责令恢复原状。

2. 处罚措施与程序：

   • 生态环境主管部门在发现企业未批先建的行为后，会依法进行调查取证，确认违法事实。
   • 根据违法情节的轻重，生态环境主管部门会作出相应的行政处罚决定，包括责令停止建设、罚款等。
   • 若企业拒不执行处罚决定，生态环境主管部门还可以依法申请人民法院强制执行。

3. 企业应对建议：

   • 企业应严格遵守环境影响评价制度，确保建设项目在开工前依法进行环境影响评价并获得审批。
   • 若企业已存在未批先建的行为，应立即停止建设，并主动向生态环境主管部门报告，积极配合调查处理，争取从轻或减轻处罚。
   • 企业还应加强内部管理，建立健全环保合规制度，防止类似违法行为再次发生。

4. 其他可能涉及的部门：

   • 虽然生态环境主管部门是未批先建行为的主要处罚部门，但在某些情况下，其他相关部门如自然资源部门、住房和城乡建设部门等也可能根据各自的职责范围对企业进行监管和处罚。例如，若企业未批先建行为同时违反了土地管理、城乡规划等相关法律法规，这些部门也可能依法进行处罚。

总结与建议：企业应严格遵守环境影响评价制度，确保建设项目合法合规。若已存在未批先建的行为，应立即停止建设并主动向生态环境主管部门报告，积极配合调查处理。同时，企业还应加强内部管理，建立健全环保合规制度，以防范法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。