结论：公司迟到1次扣200元是否算高，不能一概而论，需结合公司规章制度、劳动合同约定以及相关法律法规综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、公司规章制度与劳动合同的约定
规章制度合法性：
- 根据《劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
- 若公司规章制度中明确规定了迟到一次扣200元的条款，且该规章制度已经过上述民主程序制定并公示或告知劳动者，则该条款在合法范围内对劳动者具有约束力。
劳动合同约定：
- 劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。若劳动合同中明确约定了迟到一次的扣款金额，且该约定不违反法律法规的强制性规定，则双方应按约定履行。
二、相关法律法规的限制
工资支付规定：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 迟到扣款是否属于经济损失赔偿：迟到本身并不直接等同于给用人单位造成经济损失，除非公司能证明迟到导致了具体的经济损失（如因迟到导致的业务损失、额外加班费用等）。若仅因迟到而扣款，且扣款金额过高，可能违反上述规定。
地方性法规：
- 部分地区可能有关于迟到扣款的具体规定或限制。例如，某些地区可能规定迟到扣款不得超过劳动者日工资的某一比例。因此，在判断迟到一次扣200元是否算高时，还需考虑当地的具体法规。
三、合理性判断
扣款金额与迟到时间的比例：
- 迟到一次扣200元，需考虑该金额与迟到时间的比例是否合理。例如，若迟到仅几分钟，而扣款金额过高，则可能显得不合理。
公司整体薪酬结构：
- 还需考虑公司的整体薪酬结构。若公司薪酬水平较高，且迟到扣款在整体薪酬中占比较小，则可能相对合理；反之，则可能显得过高。
四、建议
与公司协商：
- 若认为迟到一次扣200元过高，可与公司进行协商，寻求更合理的解决方案。
向劳动监察部门投诉：
- 若公司规章制度或劳动合同中的扣款条款违反法律法规的强制性规定，或扣款金额过高且无法协商解决，可向当地劳动监察部门投诉，维护自身合法权益。
总结：公司迟到1次扣200元是否算高，需结合公司规章制度、劳动合同约定以及相关法律法规综合判断。若认为扣款过高或不合理，可与公司协商或向劳动监察部门投诉。如有具体法律问题，可直接向我咨询。