政府单位和公司签订的临时协议，在符合法律规定的情况下，是有效的。以下从多个角度对此问题进行详细分析：

一、协议有效的法律基础

1. 合同自由原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体有权依法自主订立合同，包括临时协议。只要协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且双方意思表示真实，该协议即具有法律效力。

2. 政府单位的合同签订权限：政府单位作为民事主体，在法律法规允许的范围内，有权与公司签订各类合同，包括临时协议。但需要注意的是，政府单位在签订合同时，必须确保其行为符合其法定职责和权限范围，不得超越职权或滥用职权。

二、协议有效的具体条件

1. 双方主体适格：政府单位和公司作为协议的双方，必须具备签订合同的主体资格。政府单位应是其法定职责范围内的代表，公司则应是依法注册登记并具备相应经营资质的法人或其他组织。

2. 意思表示真实：双方签订协议时，必须基于真实的意思表示，不得存在欺诈、胁迫等情形。协议内容应明确、具体，且双方对协议内容均无异议。

3. 内容合法合规：协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得违背公序良俗。例如，协议中不得包含非法交易、损害国家利益或社会公共利益等条款。

4. 形式要件完备：虽然临时协议可能不像正式合同那样需要严格的书面形式，但为了确保协议的明确性和可证明性，建议双方采用书面形式签订协议，并明确协议的有效期、双方的权利义务等关键条款。

三、协议无效或可撤销的情形

1. 无效情形：如果协议内容违反法律、行政法规的强制性规定，或者违背公序良俗，该协议将被认定为无效。例如，协议中约定进行非法交易或损害国家利益等条款。

2. 可撤销情形：如果协议签订过程中存在欺诈、胁迫等情形，导致一方意思表示不真实，受损害方有权请求人民法院或仲裁机构撤销该协议。

四、法律建议

1. 明确协议内容：在签订临时协议前，双方应充分沟通并明确协议内容，包括协议的有效期、双方的权利义务、违约责任等关键条款。

2. 审查主体资格：双方应审查对方的主体资格和签订合同的权限，确保对方具备签订协议的合法资格。

3. 保留证据：为了确保协议的履行和争议解决，双方应妥善保管与协议相关的证据材料，如协议文本、沟通记录、付款凭证等。

4. 及时咨询专业律师：如果在签订或履行协议过程中遇到法律问题或争议，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助和支持。

综上所述，政府单位和公司签订的临时协议在符合法律规定的情况下是有效的。但为了确保协议的合法性和有效性，双方应充分了解相关法律法规并谨慎签订协议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。