法院立案确认劳动关系，通常需通过劳动争议仲裁前置程序后提起诉讼，或直接以“确认劳动关系纠纷”为由向法院起诉（视地区及案件情况而定），最终由法院依法审理并作出判决。具体处理流程及要点如下：

1. 仲裁前置程序（多数地区适用）
   根据《劳动争议调解仲裁法》第五条，劳动争议需先申请仲裁，对仲裁结果不服的方可向法院起诉。因此，若需确认劳动关系，通常需先向当地劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，并提供劳动合同、工资支付记录、工作证、考勤记录等证据证明劳动关系存在。仲裁委员会将依法审理并作出裁决。

2. 直接向法院起诉（特殊情况）
   部分地区或特定案件中（如涉及社保缴纳、工伤认定等紧急需求），劳动者可直接以“确认劳动关系纠纷”为由向法院起诉，无需经过仲裁前置程序。此时需准备起诉状、证据材料（如上述证明劳动关系的证据）并提交至法院立案庭。法院将审查材料并决定是否立案。

3. 法院审理流程

   • 立案审查：法院对起诉材料进行形式审查，符合立案条件的将予以受理，并通知双方当事人。
     
   • 庭前准备：法院可能组织庭前调解，若调解不成则进入庭审阶段。双方需提交证据、证人名单等材料。
     
   • 开庭审理：法院将依法开庭审理，双方围绕劳动关系是否存在、存续时间等焦点问题进行举证、质证和辩论。
     
   • 判决与执行：法院根据审理情况作出判决，确认劳动关系是否存在。若一方不服判决，可在法定期限内上诉。判决生效后，若义务方未履行，可申请法院强制执行。

4. 注意事项

   • 证据收集：劳动关系确认案件中，证据是关键。务必提前收集并整理好能证明劳动关系的各类证据。
     
   • 时效限制：申请仲裁或提起诉讼需注意时效限制，避免因超过时效而丧失维权机会。
     
   • 专业协助：劳动关系确认案件可能涉及复杂法律问题，建议寻求专业律师协助，以提高维权效率。

建议：若您面临劳动关系确认问题，可先尝试与用人单位协商解决；协商无果的，及时咨询专业律师，根据案件情况选择合适的维权途径。如有具体案件情况或疑问，欢迎直接向我咨询。