结论：在工地发生伤残事故，公司先行赔付后向小包工头追偿，但小包工头是“黑户”（即无合法经营资质或身份不明）的情况下，法院的判决会综合考虑多个因素，包括事故责任划分、小包工头的实际承担能力以及公司的追偿依据等。以下是对此问题的详细分析：
一、事故责任划分
公司责任：
- 如果公司在安全管理、提供安全防护措施等方面存在过错，导致事故发生，公司可能需要承担一定的赔偿责任。即便公司已经先行赔付，但在追偿过程中，如果法院认定公司存在过错，可能会影响追偿的金额或比例。
小包工头责任：
- 小包工头作为实际施工管理者，如果其对事故的发生存在过错（如未提供必要的安全防护、违规操作等），则应当承担相应的赔偿责任。然而，由于小包工头是“黑户”，其可能无合法经营资质，甚至身份不明，这增加了追偿的难度。
二、小包工头的实际承担能力
财产状况：
- 法院在判决时会考虑小包工头的财产状况。如果小包工头没有足够的财产来承担赔偿责任，即使法院判决其承担责任，公司也可能难以实际获得赔偿。
身份查明：
- 如果小包工头身份不明或难以查找，公司可能需要通过其他途径（如公告送达、申请法院调查等）来推进诉讼程序。这可能会增加诉讼的成本和时间。
三、公司的追偿依据
合同关系：
- 如果公司与小包工头之间存在合同关系，且合同中明确约定了事故责任的承担方式，公司可以依据合同条款向小包工头追偿。
法律规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》等相关法律规定，因第三人造成工伤的，工伤职工可以请求第三人承担赔偿责任，也可以请求工伤保险基金或者用人单位按照规定的工伤保险待遇支付有关费用。用人单位先行支付工伤保险待遇的，可以依法向第三人追偿。在此情况下，公司作为用人单位，在先行赔付后，有权向造成事故的小包工头追偿。
四、法院可能的判决
判决小包工头承担赔偿责任：
- 如果法院认定小包工头对事故的发生存在过错，且其有足够的财产来承担赔偿责任，法院可能会判决小包工头承担相应的赔偿责任。
判决公司承担部分或全部责任：
- 如果法院认定公司在安全管理等方面存在过错，或者小包工头无法承担赔偿责任，法院可能会判决公司承担部分或全部责任。这取决于具体案情和法院的裁量权。
考虑实际执行情况：
- 在判决时，法院也会考虑判决的实际执行情况。如果小包工头是“黑户”且无财产可供执行，法院可能会在判决中明确这一点，并告知公司追偿的风险。
五、建议
收集证据：
- 公司应尽可能收集与事故相关的证据，包括事故现场照片、证人证言、医疗记录等，以证明事故的责任划分和小包工头的过错。
咨询专业律师：
- 由于此类案件涉及复杂的法律关系和证据收集，建议公司咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。
考虑其他救济途径：
- 如果小包工头确实无法承担赔偿责任，公司可以考虑通过其他途径（如向相关部门举报小包工头的违法行为、申请工伤保险基金先行支付等）来减轻自身负担。
在处理此类案件时，请随时向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。