当单位不配合法院执行时，你可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
向法院申请强制执行措施：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，如果单位不履行法院生效判决、裁定或其他法律文书确定的义务，你可以向法院申请强制执行。法院有权采取多种强制执行措施，如查封、扣押、冻结单位的财产，拍卖、变卖被查封、扣押的财产，或者对单位进行罚款等，以强制其履行义务。
申请法院对单位负责人采取限制措施：
- 如果单位拒不履行义务，且情节严重，你还可以申请法院对单位的法定代表人、主要负责人或者直接责任人员采取限制出境、在征信系统记录、通过媒体公布不履行义务信息以及法律规定的其他措施。这些措施旨在增加单位不履行义务的成本，促使其主动履行。
追究单位及相关责任人的法律责任：
- 如果单位的行为构成拒不执行判决、裁定罪，你还可以向公安机关报案，要求追究单位及相关责任人的刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，对人民法院的判决、裁定有能力执行而拒不执行，情节严重的，处三年以下有期徒刑、拘役或者罚金；情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
寻求法院协助与沟通：
- 在采取上述法律措施的同时，你也可以积极与法院沟通，说明单位不配合执行的情况，请求法院加大执行力度或提供其他协助。法院可能会根据具体情况，采取更加灵活多样的执行方式，以促成单位履行义务。
在处理此类问题时，你还需要注意以下几点：
- 保留证据：确保你拥有所有与案件相关的证据，包括法院的判决、裁定、执行通知书等法律文书，以及单位不配合执行的证据，如书面拒绝、口头拒绝的录音或录像等。
- 及时申请：一旦发现单位不配合执行，应尽快向法院申请强制执行措施，以免错过最佳时机。
- 保持沟通：与法院保持密切联系，及时了解执行进展，并根据法院的要求提供必要的协助和配合。
如果单位仍然不配合执行，你还可以考虑通过媒体曝光、向相关部门投诉等方式来施加压力。但需要注意的是，这些方式应谨慎使用，以免对单位造成不必要的负面影响或引发其他法律纠纷。
最后，我建议你如果遇到单位不配合法院执行的情况，及时向我咨询。作为专业律师，我将根据你的具体情况提供针对性的法律建议和帮助，以维护你的合法权益。