面对强制执行过程中公司不配合的情况，您可以采取以下措施来保障自己的合法权益：
一、明确法律依据与后果
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，对于拒不履行法院生效判决、裁定的行为，法院有权采取一系列强制措施。
- 法律后果：公司若拒不配合执行，可能面临罚款、拘留等处罚；情节严重的，还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。具体来说，个人最高可被罚款十万元，单位则可能被罚款五万元至一百万元，拘留期限最长可达十五日。
二、采取多种执行策略
财产查询、冻结、划拨：
- 您可以向法院提供公司的财产线索，如银行账户、房产、车辆等。
- 法院有权查询公司的存款情况，并依法冻结、划拨其存款，以清偿您的债权。
财产查封、扣押、拍卖、变卖：
- 对于公司的房产、车辆、机器设备等财产，法院可进行查封、扣押。
- 若公司仍不履行义务，法院可依法进行拍卖或变卖，所得款项用于清偿您的债权。
责令履行指定行为：
- 若执行内容涉及公司必须完成的行为（如迁出房屋、拆除违章建筑等），法院可责令其在指定期限内履行。
- 逾期不履行，法院将委托有关单位或个人代为履行，费用由公司承担。
罚款、拘留：
- 对于公司拒不配合执行的行为，法院可根据情节轻重对其处以罚款或拘留。
限制出境与纳入失信名单：
- 法院可对公司采取限制出境措施，迫使其配合执行。
- 同时，将其纳入失信被执行人名单，通过社会公示等方式限制其高消费、参与招投标等活动。
追究刑事责任：
- 若公司有能力执行而拒不执行，情节严重的，可能构成拒不执行判决、裁定罪。
- 您可向法院提起刑事自诉，或由公安机关立案侦查、检察院提起公诉。一旦罪名成立，公司将面临三年以下有期徒刑、拘役或者罚金的处罚；情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
三、加强沟通与协调
耐心释法明理：
- 您可以与执行人员沟通，请求其与公司进行充分沟通，向公司解释相关法律法规和执行程序。
- 阐明拒不履行的法律后果，争取公司主动配合。
寻求第三方协助：
- 您可以邀请公司的亲友、行业协会或商会等第三方参与调解，共同做公司的思想工作。
- 促进公司履行义务，减少执行过程中的阻力。
四、申请人应配合的行动
提供财产线索：
- 您应积极向法院提供公司的财产线索，以便法院能够更准确地采取查封、扣押、冻结等措施。
关注执行进展：
- 您应密切关注执行进展，及时与法院沟通，了解执行情况。
- 配合法院采取必要的执行措施，确保执行工作的顺利进行。
五、其他注意事项
执行异议：
- 若您对执行行为有异议，认为执行行为违反法律规定，可向法院提交书面异议。
- 法院将在收到异议后15天内进行评估，理由成立则将撤销或纠正执行行为。
申请复议：
- 若您对法院的裁定结果不服，可在裁定通知送达后10天内向上一级法院申请复议。
总结与建议：面对公司不配合强制执行的情况，您应充分利用法律赋予的权利，通过法院采取多种强制执行措施来保障自己的合法权益。同时，积极与法院沟通、提供财产线索、关注执行进展，并寻求第三方的协助，共同推动执行工作的顺利进行。若遇到任何问题或异议，及时向法院提出，以确保执行的合法性和公正性。如果您在执行过程中遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。