工厂在工人自动离职的情况下，解除劳动合同需依法进行，并应出具合法有效的解除劳动合同通知书。以下是具体操作步骤和注意事项：

1. 确认自动离职事实：

   • 工厂应首先确认工人确实存在自动离职的行为，即未经工厂同意，擅自离开工作岗位，且未履行请假或辞职手续。
   • 工厂应收集相关证据，如考勤记录、工作交接情况、同事证言等，以证明工人的自动离职行为。

2. 发送催告通知：

   • 在确认工人自动离职后，工厂应先向工人发送催告通知，要求其限期返回工作岗位或办理离职手续。
   • 催告通知应明确告知工人，若未在规定期限内返回或办理手续，工厂将依法解除劳动合同。

3. 依法解除劳动合同：

   • 若工人在催告期限内仍未返回工作岗位或办理离职手续，工厂可以依据《劳动合同法》的相关规定，解除与工人的劳动合同。
   • 解除劳动合同的原因应明确为“工人自动离职，经催告未归”。

4. 出具解除劳动合同通知书：

   • 工厂应出具书面的解除劳动合同通知书，并确保通知书内容合法、准确、完整。
   • 通知书应包含以下内容：
     • 工人的基本信息（姓名、性别、身份证号码等）；
     • 劳动合同的基本信息（签订日期、合同期限等）；
     • 解除劳动合同的原因（工人自动离职，经催告未归）；
     • 解除劳动合同的日期；
     • 工厂的名称、盖章及日期；
     • 告知工人办理离职手续、结算工资及经济补偿（如有）等相关事宜。

5. 送达解除劳动合同通知书：

   • 工厂应确保解除劳动合同通知书送达工人本人。若工人无法联系或拒绝签收，工厂可以通过邮寄、公告等方式送达。
   • 送达后，工厂应保留好送达证据，如邮寄回执、公告截图等。

6. 办理后续手续：

   • 工厂应按照法律法规的规定，为工人办理离职手续，包括结算工资、缴纳社会保险费至离职当月、出具离职证明等。
   • 若工人符合经济补偿的条件，工厂还应依法支付经济补偿。

注意事项：

• 工厂在解除劳动合同过程中，应严格遵守法律法规的规定，确保程序合法、内容准确。
• 若工人对解除劳动合同有异议，可能会引发劳动争议。因此，工厂在解除劳动合同前，应充分评估风险，并准备好相关证据以应对可能的劳动争议。
• 如有需要，工厂可以咨询专业律师或劳动保障部门，以确保解除劳动合同的合法性和有效性。

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