若公司存在操纵证券市场的行为，员工可从以下不同情况来处理：

1. 员工未参与操纵行为

   • 法律责任层面：从法律角度而言，未参与操纵证券市场行为的员工通常无需承担操纵市场相关的法律责任。操纵证券市场行为一般需要具备主观故意以及实施了相应的操纵行为等要件，未参与其中则不符合这些构成要件。例如，员工只是从事正常的行政、后勤等基础工作，没有参与到操纵市场的策划、实施等环节，就不会被认定为操纵市场的违法主体。
   • 应对措施：员工可以继续正常履行自己的工作职责，但需要关注公司的动态以及监管部门的调查情况。如果监管部门对公司进行调查，员工有义务配合调查工作，如实提供自己所了解的情况，但要注意仅提供与自己工作相关的真实信息，避免因不当陈述给自己带来不必要的麻烦。同时，员工也可以考虑收集一些能够证明自己未参与操纵行为的相关证据，如工作记录、邮件往来等，以备不时之需。

2. 员工参与操纵行为但不知情

   • 法律责任层面：这种情况相对复杂，虽然员工主观上没有操纵市场的故意，但如果其行为客观上为操纵市场提供了帮助，仍有可能面临一定的法律风险。例如，员工按照上级指示进行了一些看似正常的交易操作，但实际上这些操作是操纵市场计划的一部分，而员工并不知情。在这种情况下，员工可能会被认定为从犯或者被认定为存在过失，需要承担相应的法律责任，不过责任程度相对较轻。具体的责任认定需要根据员工的行为性质、在操纵行为中所起的作用等因素综合判断。
   • 应对措施：员工应尽快收集能够证明自己不知情的相关证据，如与上级的沟通记录、工作指令等，以证明自己是在不知情的情况下参与了相关行为。同时，要积极配合监管部门的调查，如实陈述自己所知道的情况，表明自己没有操纵市场的主观故意。如果可能的话，员工还可以寻求法律帮助，通过专业的法律分析来维护自己的合法权益。

3. 员工参与操纵行为且知情

   • 法律责任层面：员工将面临较为严重的法律后果。操纵证券市场是严重的违法行为，根据《中华人民共和国证券法》等相关法律法规的规定，参与操纵市场的员工可能会被处以罚款、没收违法所得等行政处罚；情节严重的，还可能构成操纵证券市场罪，面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役和罚金等。例如，员工积极参与操纵市场的策划、实施，通过虚假申报、连续交易等手段操纵证券价格，获取非法利益，一旦被查实，将受到法律的严厉制裁。
   • 应对措施：员工应立即停止参与操纵行为，避免进一步扩大违法后果。同时，要主动向监管部门自首，如实交代自己的违法行为，争取从轻或者减轻处罚。根据相关法律规定，自首是法定从轻或者减轻处罚的情节之一。此外，员工还可以积极退还违法所得，这也是表明悔罪态度的重要方式。在处理过程中，员工应积极配合调查和司法程序，如实提供相关信息和证据。

无论员工处于哪种情况，都要重视公司操纵证券市场这一行为，根据自身实际情况采取合适的应对措施。如果你还有其他关于公司操纵证券市场员工处理方面的疑问，或者涉及其他法律问题，都可以直接向我咨询。