结论：单位规定病假三个月是否合法，不能一概而论，需结合具体情况判断，包括医疗期规定、单位规章制度合法性及是否与劳动者协商一致等因素。
详细分析：
医疗期规定：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。医疗期的长度根据劳动者本人实际参加工作年限和在本单位工作年限确定，一般为3个月到24个月不等。
- 在您的情况下，您已经在本单位工作了十一年，根据规定，您的医疗期可能会相对较长，但具体长度还需参考您所在地区的具体实施细则和您的实际病情。
单位规章制度合法性：
- 单位有权根据自身情况制定规章制度，包括病假政策。然而，这些规章制度必须符合国家法律法规的规定，不能侵犯劳动者的合法权益。
- 如果单位规定的病假期限短于法定医疗期，或者单位在病假期间无故解除劳动合同、降低工资等，都可能构成违法行为。
- 反过来，如果单位规定的病假期限长于法定医疗期，且不违反其他法律法规，那么这样的规定是合法的，但并非强制要求单位必须这样做。
与劳动者协商一致：
- 即使单位有规章制度规定病假期限，但在实际操作中，单位也应与劳动者进行充分沟通，尽量达成一致意见。
- 如果劳动者因病情需要更长的病假时间，且能够提供医疗证明，单位应考虑给予合理的延长。
建议：
- 核实医疗期：首先，您需要核实自己根据法律规定应享有的医疗期长度。这可以通过查阅相关法律法规或咨询当地劳动部门来确认。
- 审查单位规章制度：其次，您需要审查单位的病假政策，看其是否与法律法规相冲突，以及是否合理、公平。
- 与单位沟通：如果您认为单位的病假政策存在问题，或者您的病情需要更长的病假时间，建议您与单位进行沟通，寻求合理的解决方案。
- 寻求法律援助：如果沟通无果，且您认为自己的合法权益受到了侵犯，您可以考虑寻求法律援助，通过法律途径维护自己的权益。
示例说明：
假设您根据法律规定应享有的医疗期为6个月，而单位规定病假为3个月。在这种情况下，单位的规定就短于法定医疗期，可能构成违法行为。您有权要求单位按照法定医疗期给予您病假，并在病假期间享受相应的工资待遇。如果单位拒绝，您可以向当地劳动部门投诉或寻求法律援助。