代持人非法0元转让股份的赔偿计算需结合具体法律关系及损害后果综合判定，主要涉及违约赔偿、侵权赔偿及股权价值评估三个维度。以下分情况说明：

1. 违约赔偿：以代持协议约定为基准

若代持人与实际出资人签订了书面代持协议，且协议中明确约定了股权转让限制条款（如“未经同意不得转让”“转让需按特定价格”等），代持人擅自0元转让的行为构成根本违约。此时赔偿范围包括：

• 直接损失：实际出资人因股权被低价转让而减少的财产价值（如股权市场价与0元的差额）；
• 预期利益损失：若代持协议约定了股权分红、增值收益分配规则，实际出资人可主张因转让导致的未来收益损失；
• 违约金：若协议约定了违约金条款，实际出资人可同时主张违约金（但需注意法院可能根据实际损失调整违约金数额）。

法律依据：《民法典》第577条（违约责任）、第584条（损失赔偿范围）。

2. 侵权赔偿：以股权实际价值为核心

若代持协议无效或未约定违约条款，实际出资人可基于侵权法律关系主张赔偿。此时需证明：

• 侵权行为：代持人未经授权擅自处分股权；
• 损害结果：股权被0元转让导致实际出资人财产减少；
• 因果关系：转让行为与损失之间存在直接关联。

赔偿范围为股权的实际市场价值，通常需通过评估确定。评估时需考虑：

• 公司净资产、盈利能力、行业前景等财务指标；
• 股权转让时点的市场行情；
• 是否存在其他影响股权价值的因素（如公司负债、诉讼风险等）。

法律依据：《民法典》第1165条（侵权责任）、第1184条（财产损失计算）。

3. 特殊情形：名义股东与实际出资人的权责划分

若代持关系未被公司或其他股东认可，实际出资人可能需先通过“股权确认之诉”明确股东身份，再主张赔偿。此时需注意：

• 公司章程限制：若公司章程对股权转让有特别规定（如优先购买权），代持人违反规定转让可能导致合同无效或可撤销；
• 善意第三人保护：若受让人为善意（不知代持关系且支付合理对价），实际出资人可能无法直接追回股权，只能向代持人主张赔偿。

操作建议：

1. 立即固定证据（代持协议、股权转让协议、公司章程、财务报告等）；
2. 委托专业机构评估股权价值；
3. 根据具体情况选择违约之诉或侵权之诉路径；
4. 若涉及善意第三人，需优先通过协商或诉讼确认股权归属。

提示：股权代持法律关系复杂，赔偿计算需结合具体证据和司法实践。如有进一步问题，可直接向我咨询具体案件细节。