核心结论：若转让股份时存在不知情代持的情况，可通过确认代持协议效力、收集证据证明不知情、协商解决、诉讼解决等途径来处理。以下为详细分析：
- 确认代持协议效力
- 首先需要审查代持协议是否符合法律规定的生效要件。如果代持协议是双方真实意思表示，不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该协议是有效的。在这种情况下，实际出资人（即被代持人）有权依据协议主张自己的权益。
- 若代持协议存在无效情形，例如以合法形式掩盖非法目的、损害社会公共利益等，那么协议自始无效。此时，需要根据具体情况来确定股份的归属以及各方的责任。比如，如果是因为代持人擅自转让股份导致被代持人不知情，且代持协议无效，那么代持人可能需要承担返还股份或赔偿损失等责任。
- 收集证据证明不知情
- 被代持人需要收集能够证明自己对股份转让代持不知情的证据。这些证据可以包括与代持人之间的沟通记录，如短信、邮件、聊天记录等，其中没有提及代持及股份转让相关事宜；也可以是没有参与股份转让相关决策过程的证明，例如没有出席相关股东会议、没有签署相关文件等。
- 如果有其他证人能够证明被代持人不知情，如公司的其他股东、员工等，他们的证人证言也可以作为重要证据。收集证据的目的是为了在后续的协商或诉讼中，能够有力地支持自己的主张，证明自己不应承担因不知情代持而产生的不利后果。
- 协商解决
- 在发现转让股份存在不知情代持情况后，各方可以首先尝试通过协商的方式解决问题。被代持人可以与代持人、股份受让人进行沟通，说明自己的情况，要求撤销股份转让行为或者获得相应的补偿。
- 协商过程中，各方可以依据代持协议的约定（如果有）、相关法律法规以及公平合理的原则，就股份的归属、转让价款的返还、损失的赔偿等问题进行协商。如果能够达成一致意见，可以签订书面协议，明确各方的权利和义务，以避免后续再次产生纠纷。
- 诉讼解决
- 如果协商无法达成一致意见，被代持人可以考虑通过诉讼的方式维护自己的合法权益。根据具体情况，被代持人可以选择不同的诉讼请求。
- 如果被代持人希望确认股份转让行为无效，恢复自己对股份的所有权，可以以代持人和股份受让人为被告，向法院提起确认合同无效之诉。在诉讼中，需要提供充分的证据证明自己对代持及股份转让不知情，以及股份转让行为存在无效情形。
- 如果被代持人因不知情代持遭受了经济损失，如股份价值贬损、因诉讼产生的费用等，可以以代持人为被告，提起损害赔偿之诉，要求代持人赔偿自己的损失。在诉讼过程中，要准确计算损失的金额，并提供相应的证据予以支持。
在处理转让股份被不知情代持的问题时，情况往往比较复杂，涉及到多方面的法律知识和证据收集。如果你正面临这样的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供详细的法律建议和解决方案。