结论：女儿的使用权本身通常不能直接阻止父母办理不动产权证，但具体能否阻止需结合房屋产权归属、使用权来源及是否存在其他法律障碍等因素综合判断。以下从不同角度详细分析：
一、房屋产权归属是核心前提
若房屋产权归父母所有：
- 根据《民法典》相关规定，不动产权证的办理是基于房屋产权归属的。若房屋产权明确归父母所有，父母作为产权人，有权依法办理不动产权证，女儿的使用权（无论基于何种原因取得）通常不能成为阻止父母办理不动产权证的合法理由。
- 例外情况：如果女儿的使用权是通过合法租赁、借住等方式取得，且租赁或借住合同中明确约定了女儿在特定条件下（如租赁期内）享有阻止产权变更或办理相关手续的权利，那么女儿可能在一定程度上能阻止父母办理不动产权证，但这需要具体合同条款的支持。
若房屋产权存在争议或未明确归属：
- 在房屋产权存在争议或未明确归属的情况下，任何一方（包括父母和女儿）都可能无法单独办理不动产权证。此时，女儿的使用权可能成为争议的一部分，但并不能直接决定不动产权证的办理与否，而是需要通过法律途径（如诉讼、仲裁等）解决产权争议后，再根据判决结果办理不动产权证。
二、使用权来源及性质影响
合法取得的使用权：
- 如果女儿的使用权是通过合法方式（如继承、赠与、租赁等）取得的，且该使用权不违反法律法规的强制性规定，那么女儿在使用权范围内享有相应的权益。然而，这种权益通常并不包括阻止父母办理不动产权证的权利，除非如前所述，存在特定合同条款的约定。
非法取得的使用权：
- 如果女儿的使用权是通过非法方式（如侵占、擅自占用等）取得的，那么这种使用权不受法律保护。父母作为房屋的合法产权人或有权处分人，有权要求女儿停止侵占或擅自占用行为，并办理不动产权证。
三、其他法律障碍的考虑
是否存在抵押、查封等限制：
- 如果房屋存在抵押、查封等法律限制，那么无论女儿是否享有使用权，父母都无法办理不动产权证。此时，女儿的使用权与不动产权证的办理无直接关联。
是否存在家庭内部协议或约定：
- 如果家庭内部存在关于房屋产权或使用权的协议或约定，且该协议或约定合法有效，那么女儿的使用权可能受到该协议或约定的限制。在这种情况下，女儿能否阻止父母办理不动产权证需根据协议或约定的具体内容来判断。
四、法律建议
明确房屋产权归属：
- 父母和女儿应首先明确房屋的产权归属，这是解决所有争议的基础。如果产权归属不明确，建议通过法律途径（如诉讼、仲裁等）解决争议。
审查使用权来源及合同条款：
- 如果女儿享有使用权，应审查其使用权来源及是否存在相关合同条款的约定。如果存在合法有效的合同条款约定女儿在特定条件下享有阻止产权变更或办理相关手续的权利，那么应尊重合同条款的约定。
寻求法律帮助：
- 如果父母和女儿在不动产权证办理问题上存在争议且无法自行解决，建议寻求专业律师的法律帮助。律师可以根据具体情况提供法律意见和解决方案，帮助双方化解争议。
如有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。