申请国家赔偿的计算时效并非必须从行政行为确认违法之日起算，而是从赔偿请求人知道或者应当知道国家机关及其工作人员行使职权时的行为侵犯其人身权、财产权之日起计算，但被羁押等限制人身自由期间不计算在内。以下是详细解释：
一、一般规定
根据《中华人民共和国国家赔偿法》第三十九条的规定，赔偿请求人请求国家赔偿的时效为两年。这一时效的起算点，是赔偿请求人知道或者应当知道国家机关及其工作人员行使职权时的行为侵犯其人身权、财产权之日。这意味着，即使行政行为尚未被确认违法，只要赔偿请求人知道或应当知道其权益受到侵害，就可以开始计算赔偿请求时效。
二、特殊情况下的时效起算
行政行为被确认违法后的时效：虽然时效的起算点并非必须从行政行为确认违法之日起算，但如果行政行为在赔偿请求时效期间内被确认违法，这通常会对赔偿请求的提出和审理产生影响。赔偿请求人可以在确认违法后，根据具体情况，在剩余的时效期间内提出赔偿请求。
时效中止与延长：在赔偿请求时效的最后六个月内，如果因不可抗力或其他障碍导致赔偿请求人不能行使请求权，时效将中止。中止时效的原因消除后，赔偿请求时效期间继续计算。这为赔偿请求人提供了在特殊情况下延长时效的可能性。
三、行政行为确认违法与赔偿请求的关系
行政行为被确认违法，是赔偿请求人提出国家赔偿请求的一个重要前提。然而，这并不意味着时效必须从确认违法之日起算。实际上，赔偿请求人可以在知道或应当知道其权益受到侵害后，随时在法定时效期间内提出赔偿请求。行政行为的确认违法，只是为赔偿请求的提出和审理提供了更为明确的法律依据。
四、法律建议
及时行使权利：赔偿请求人应在知道或应当知道其权益受到侵害后，及时行使赔偿请求权，避免因时效过期而丧失请求赔偿的机会。
关注时效中止与延长：在赔偿请求时效期间内，如果因不可抗力或其他障碍导致无法行使请求权，应及时了解时效中止与延长的相关规定，确保自身权益不受损害。
咨询专业律师：在提出国家赔偿请求前，建议咨询专业律师，了解具体的法律程序和要求，以便更好地维护自身权益。
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