您好，关于您提出的“员工试用期三个月是否合法”的问题，我可以为您详细解答。

首先，我们需要明确的是，试用期的长短并不是由用人单位或劳动者单方面随意决定的，而是受到《劳动合同法》的明确规定和限制。根据《劳动合同法》第十九条的规定，试用期长短与劳动合同期限长短有直接关系，具体规定如下：

1. 劳动合同期限三个月以上不满一年的，试用期不得超过一个月；
2. 劳动合同期限一年以上不满三年的，试用期不得超过二个月；
3. 三年以上固定期限和无固定期限的劳动合同，试用期不得超过六个月。

针对您的情况，如果您与单位签订的是两年期限的劳动合同，那么根据上述规定，试用期最长期限不得超过两个月。因此，如果单位与您约定了三个月的试用期，那么这一约定是不合法的。

此外，我还想提醒您的是，试用期期限有法定上限，且不能随意延长。同一用人单位与同一劳动者只能约定一次试用期，这意味着法律禁止以任何理由（包括“不合格”、“需继续考察”等）延长或重新约定试用期。

如果您在试用期内遇到了任何问题或权益受到了侵害，建议您及时与单位沟通协商，或者向当地的劳动人事争议仲裁机构寻求帮助。

希望以上解答能够对您有所帮助，如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。