间接持有公司5%以上股份的股东，通常会被视为公司的关联方，但具体还需结合关联关系的认定标准及实际情况综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

一、关联方的法律定义与认定标准

根据《公司法》及相关法规，关联方通常指的是与公司存在特定关系，可能影响公司独立决策或利益的自然人、法人或其他组织。这些特定关系包括但不限于：

1. 股权关系：直接或间接持有公司一定比例股份的股东，以及这些股东的关联人（如配偶、子女、父母等直系亲属，或受其控制的企业等）。
2. 控制关系：能够对公司决策产生重大影响，或实际控制公司运营的自然人、法人或其他组织。
3. 管理关系：公司的董事、监事、高级管理人员及其关联人。

在股权关系方面，虽然法律并未明确规定“间接持有5%以上股份即构成关联方”的固定比例，但实践中，间接持有公司较大比例股份（如5%以上）的股东，往往因其对公司具有潜在的影响力，而被视为关联方。这种认定有助于防止关联交易中的利益输送，保护公司及其他股东的利益。

二、间接持股与关联方的具体判断

1. 间接持股的路径：间接持股通常通过多层投资结构实现，如通过子公司、合伙企业等间接持有目标公司的股份。在判断是否构成关联方时，需穿透这些投资结构，查看最终持股比例及影响力。
2. 影响力评估：除了持股比例外，还需评估间接持股股东对公司决策的实际影响力。这包括但不限于参与公司治理、影响公司战略决策、推荐或选举董事等。
3. 案例参考：在实际案例中，法院或监管机构会根据具体情况，综合持股比例、影响力、交易性质等因素，判断间接持股股东是否构成关联方。例如，若间接持股股东通过多层结构实际控制公司，或其决策对公司具有重大影响，则很可能被认定为关联方。

三、关联方认定的法律后果

一旦被认定为关联方，相关股东或交易方需遵守更严格的法律规范，如：

1. 信息披露义务：关联方需及时、准确地向公司及其他股东披露其持股情况、交易情况等信息。
2. 关联交易限制：关联方与公司之间的交易需遵循公平、公正、公开的原则，避免利益输送。必要时，需经公司董事会或股东会审议批准。
3. 法律责任：若关联方违反相关法律法规，可能面临行政处罚、民事赔偿甚至刑事责任。

四、建议与注意事项

1. 合规审查：对于间接持股的股东，建议定期进行合规审查，确保持股结构及交易行为符合法律法规要求。
2. 专业咨询：在涉及关联交易或关联方认定时，建议咨询专业律师或会计师，以获取准确的法律意见和财务建议。
3. 完善治理：公司应完善治理结构，加强内部控制，防止关联方利用其地位损害公司利益。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。