持股5%以上股东的控股股东，在特定条件下可被认定为关联方。以下从不同角度进行详细分析：

一、关联方的法律定义

根据《公司法》及相关法规，关联方通常指的是与本公司存在直接或间接控制关系，或存在重大影响的企业、单位或个人。这包括但不限于：

1. 控制关系：一方能够直接或间接控制另一方的财务和经营政策，或能通过协议、合同等方式对另一方的财务和经营政策产生重大影响。
2. 共同控制或重大影响：双方或多方共同控制某项经济活动，或一方对另一方的财务和经营政策有参与决策的权力，但并不决定这些政策。

二、持股5%以上股东的控股股东与关联方的关系

1. 直接控制：

   • 如果持股5%以上的股东本身就是一个控股股东，即其通过直接或间接方式持有其他公司足够比例的股份，从而能够控制该公司的财务和经营政策，那么该控股股东自然成为关联方。

2. 间接控制或重大影响：

   • 即使持股5%以上的股东不是直接控股股东，但其通过与其他股东或管理层的协议、合同等方式，对目标公司的财务和经营政策产生重大影响，也可能被视为关联方。
   • 此外，如果该股东的控股股东（即该股东被其他主体所控制）对目标公司有直接或间接的控制关系，那么该控股股东也可能因“关联关系”的传递性而被视为目标公司的关联方。

3. 特定交易或安排中的关联方认定：

   • 在某些特定交易或安排中，如关联交易、资产重组等，即使持股比例不足5%的股东，如果因其与目标公司存在特殊关系（如共同控制、重大影响等），也可能被认定为关联方。同理，持股5%以上股东的控股股东在这些情境下更易被认定为关联方。

三、实际案例与司法实践

• 在司法实践中，法院在认定关联方时，会综合考虑多种因素，包括但不限于持股比例、控制关系、重大影响等。因此，持股5%以上股东的控股股东是否被认定为关联方，需根据具体案件事实和法律规定进行综合判断。

四、法律建议

• 对于公司而言：在与持股5%以上股东或其控股股东进行交易时，应谨慎评估其是否构成关联方，以避免关联交易带来的法律风险和财务风险。
• 对于投资者而言：在投资决策过程中，应充分了解目标公司的股权结构和关联方情况，以评估投资风险和收益。
• 合规建议：公司应建立健全关联交易管理制度，明确关联方的认定标准和交易审批程序，确保关联交易的合法性和合规性。

总结：持股5%以上股东的控股股东在特定条件下可被认定为关联方，这取决于其是否对目标公司存在直接或间接的控制关系或重大影响。在实际操作中，需根据具体案件事实和法律规定进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。