外包员工被扣工资是否合法，需根据具体情况来判断。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定与规章制度：

   • 如果外包员工与用人单位（或外包公司）在劳动合同中明确约定了工资支付方式、条件及扣减情形，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么按照合同约定执行是合法的。例如，合同中约定因员工旷工、迟到等违反规章制度的行为可以扣除相应工资，且扣除比例合理，这样的扣减就是合法的。
   • 同时，如果用人单位或外包公司有明确的规章制度，且该制度已经过民主程序制定并公示，员工也已知晓并同意，那么按照规章制度执行扣减工资也是合法的。

2. 法律法规的限制：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，除非有合法依据（如合同约定、规章制度、法律规定等），否则用人单位不能随意扣减员工工资。
   • 特别地，对于最低工资标准，用人单位支付给劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。如果扣减后的工资低于最低工资标准，那么这种扣减就是违法的。

3. 扣减工资的合理性：

   • 即使合同或规章制度中有关于扣减工资的规定，扣减的金额也必须合理。例如，因员工轻微迟到而扣除大量工资，或者因员工一次小错误而扣除整月工资等，这样的扣减显然是不合理的，也是违法的。
   • 合理性判断通常需要考虑扣减比例、扣减原因、员工过错程度以及用人单位的实际损失等因素。

法律建议：

• 如果外包员工认为自己的工资被非法扣减，首先应当查看劳动合同和用人单位的规章制度，了解扣减工资的依据和合理性。
• 如果认为扣减不合法或不合理，可以与用人单位进行协商，要求恢复工资或给予合理补偿。
• 如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果用人单位非法扣减工资，可能会面临劳动监察部门的处罚，包括责令支付工资、加付赔偿金等。
• 同时，用人单位还可能因违法行为而损害自身声誉，影响员工士气和团队稳定性。

总之，外包员工被扣工资是否合法，需根据合同约定、规章制度以及法律法规的综合判断。如有任何疑问或争议，建议直接向我咨询，以便更准确地了解具体情况并给出专业建议。