监理单位对施工单位罚款后，罚款的最终归属取决于罚款的性质和合同约定，通常有以下两种情况：

1. 罚款作为违约金或赔偿金，归建设单位（业主）所有
   若监理单位依据施工合同中约定的“违约责任条款”对施工单位进行罚款（例如因工期延误、质量不达标等违约行为），罚款本质属于施工单位向建设单位支付的违约金或赔偿金。此时，罚款通常由建设单位收取，用于弥补其因施工单位违约造成的损失。监理单位仅作为合同执行方，负责监督并依据合同条款提出罚款建议，最终款项由建设单位与施工单位结算。

2. 罚款作为安全文明施工措施费的一部分，可能由建设单位代管或专项使用
   若罚款是针对施工单位违反安全文明施工规定（如未佩戴安全帽、乱堆放材料等），且合同中明确此类罚款需从“安全文明施工措施费”中扣除，则罚款可能由建设单位代管，或直接用于补充安全措施费用。例如，某工程合同约定“安全文明施工措施费为固定金额，施工单位违规罚款从该费用中扣除”，此时罚款最终用于项目安全投入，而非归个人或监理单位所有。

关键提醒：

• 监理单位无权自行设立罚款条款或随意罚款，其罚款依据必须来自施工合同、法律法规（如《建设工程安全生产管理条例》）或建设单位授权。
  
• 若合同未明确罚款归属，施工单位可要求建设单位出具书面说明，或通过协商、诉讼确认款项流向。
  
• 实践中，部分监理单位可能以“罚款”名义扣款，但实际未上交建设单位，而是自行留存，此行为涉嫌违法，施工单位可向建设行政主管部门投诉。

如有具体合同条款或罚款通知，可进一步分析款项性质及归属，欢迎随时咨询。