国企部门员工被治安拘留，部门负责人应依据企业内部规章制度、国家法律法规，结合具体情况进行妥善处理，具体处理方式需分情况讨论：

1. 立即了解情况并核实信息
   部门负责人应第一时间与涉事员工本人、公安机关或相关单位取得联系，核实治安拘留的具体原因、拘留期限及案件性质（如是否涉及违法犯罪行为）。若员工因个人行为（如赌博、嫖娼、酒驾等）被拘留，需明确其行为是否违反企业内部纪律或国家法律法规；若因工作原因（如执行公务时与他人冲突）被拘留，则需进一步评估事件责任归属。

2. 依据企业内部制度处理

   • 若员工行为违反企业内部纪律（如《员工手册》《奖惩条例》中明确禁止的行为），部门负责人应按照制度规定启动纪律处分程序。例如，根据情节轻重给予警告、记过、降级、撤职或解除劳动合同等处分。
     
   • 若企业内部制度未明确规定，可参考《国有企业领导人员廉洁从业若干规定》《劳动法》《劳动合同法》等相关法律法规，结合员工行为的社会危害性、企业声誉影响等因素综合判断处理方式。
     
   • 若员工被追究刑事责任（如治安拘留后转为刑事拘留），根据《劳动合同法》第三十九条，企业可直接解除劳动合同且无需支付经济补偿。

3. 考虑对工作的影响并采取补救措施

   • 工作交接：若员工被拘留期间无法履行职责，部门负责人应安排其他员工接替其工作，确保部门运转不受影响。
     
   • 风险评估：若员工行为涉及企业利益（如泄露商业秘密、贪污受贿等），需立即启动内部调查，必要时向公安机关报案或向纪检监察机关报告。
     
   • 声誉管理：若事件可能引发舆论关注，部门负责人应协同企业公关部门制定应对方案，避免对企业形象造成负面影响。

4. 合法合规处理，避免程序瑕疵

   • 程序公正：在启动纪律处分前，需确保员工享有陈述、申辩的权利，避免因程序违法导致处分无效。
     
   • 证据固定：收集员工被拘留的相关证明材料（如拘留通知书、公安机关出具的说明等），作为处分依据。
     
   • 工会参与：若涉及解除劳动合同等重大处分，需按《劳动合同法》第四十三条规定事先通知工会，并听取工会意见。

5. 后续跟进与员工关怀

   • 法律援助：若员工因误解或冤枉被拘留，部门负责人可协助其联系法律援助，维护合法权益。
     
   • 心理疏导：若员工因拘留产生心理问题，可建议其接受心理咨询，帮助其回归正常工作状态。
     
   • 制度完善：针对事件暴露的管理漏洞，部门负责人应推动企业完善相关制度，预防类似事件再次发生。

总结：部门负责人在处理此类事件时，需平衡企业纪律、法律法规与员工权益，确保处理方式合法、合规、合理。若对具体操作存在疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供详细建议。