行政单位未及时清退保证金，主要违反了《中华人民共和国行政许可法》以及相关行政法规中关于保证金管理和退还的规定。以下从不同角度进行详细分析：

1. 违反《中华人民共和国行政许可法》的相关规定：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国行政许可法》第七十条，行政机关应当健全监督制度，通过核查反映被许可人从事行政许可事项活动情况的有关材料，履行监督责任。同时，该法也规定了行政机关在特定情形下应当依法办理有关行政许可的注销手续，这间接涉及到了保证金等费用的处理。虽然直接条款可能并未明确提及“未及时清退保证金”，但行政机关在行政许可过程中收取的保证金，在许可事项完成或条件满足后，应及时退还，这是行政机关的法定义务。
   • 法律后果：如果行政单位未及时清退保证金，可能构成行政不作为或滥用职权，被许可人或相关权利人有权依法申请行政复议或提起行政诉讼，要求行政单位履行退还保证金的义务，并可能要求赔偿因此造成的损失。

2. 违反相关行政法规中关于保证金管理和退还的具体规定：

   • 具体法规：除了《行政许可法》外，不同领域可能还有具体的行政法规或规章对保证金的管理和退还作出规定。例如，在工程建设领域，可能有关于工程质量保证金的退还规定；在招投标领域，可能有关于投标保证金的退还规定等。
   • 法律后果：行政单位未按照这些具体规定及时清退保证金的，除了可能面临被许可人或相关权利人的法律诉求外，还可能受到上级行政机关的监督和问责，包括责令改正、通报批评等。

3. 从行政合同的角度分析：

   • 行政合同性质：保证金条款往往作为行政合同的一部分，行政单位与相对人之间就保证金的缴纳、管理和退还等事项达成合意。
   • 合同义务：行政单位作为合同的一方，有义务按照合同约定及时清退保证金。如果未履行这一义务，则构成违约，应承担相应的违约责任。
   • 法律救济：相对人可以依据行政合同的相关规定，要求行政单位履行退还保证金的义务，并可以依法申请行政复议或提起行政诉讼来维护自己的合法权益。

建议与行动：

• 如果您作为被许可人或相关权利人遇到行政单位未及时清退保证金的情况，首先应当与行政单位进行沟通协商，要求其履行退还义务。
• 如果沟通无果，您可以依法向该行政单位的上级机关申请行政复议，或者向人民法院提起行政诉讼，要求行政单位退还保证金并赔偿损失。
• 在整个过程中，建议您保留好相关证据，如保证金缴纳凭证、行政许可文件、沟通记录等，以便在需要时提供证明。

如有任何进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。