结论前置：公益岗在生病期间扣工资是否合法，需根据具体情况判断，主要看是否符合病假工资支付规定以及单位规章制度是否合法合理。
一、病假工资支付规定
根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》以及各地相关实施细则，职工在医疗期内，用人单位应当按照不低于当地最低工资标准的80%支付病假工资或疾病救济费。这意味着，如果公益岗员工在医疗期内，单位扣减其工资至低于这一标准，则是不合法的。
二、单位规章制度的影响
合法合理的规章制度：如果单位有合法合理的规章制度，且该制度明确规定了病假期间的工资支付标准，且这一标准不低于法定最低标准，那么单位按照规章制度执行是合法的。但规章制度必须经过民主程序制定，且已向员工公示或告知，否则可能因程序违法而无效。
违法或不合理规章制度：如果单位的规章制度违反了法律法规的强制性规定，或者虽然不违法但明显不合理（如病假期间工资为零），那么这样的规章制度是无效的，单位不能依据其扣减员工工资。
三、特殊情况考虑
医疗期长短：医疗期的长短根据员工的工作年限和在本单位的工作年限确定，医疗期内单位不得随意解除劳动合同，且应支付病假工资。如果公益岗员工的医疗期已满，但因病情严重仍需继续治疗，单位在支付一定期限的疾病救济费后，可以解除劳动合同，但需按照法律规定支付经济补偿。
单位性质：虽然公益岗可能具有一定的特殊性，但在劳动关系上，公益岗员工与单位之间仍然适用《劳动法》、《劳动合同法》等相关法律法规。因此，在病假工资支付问题上，公益岗员工与普通企业员工享有同等的权利。
四、建议与行动
核实单位规章制度：公益岗员工应首先核实单位的规章制度，了解病假期间的工资支付标准。
与单位沟通：如果发现单位扣减工资不符合规定，应与单位进行沟通，要求单位按照法律法规和规章制度支付病假工资。
寻求法律援助：如果沟通无果，可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
总结：公益岗在生病期间扣工资是否合法，需综合考虑病假工资支付规定、单位规章制度以及特殊情况等因素。如果单位扣减工资不符合规定，员工应积极维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。