扣农村公益岗工资是否合法，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
合同约定与规章制度：
- 农村公益岗的工资发放通常受劳动合同或相关规章制度的约束。如果合同或规章制度中明确规定了扣减工资的情形（如旷工、迟到早退、工作失误造成损失等），且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么在符合这些情形时，扣减工资可能是合法的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三条，依法订立的劳动合同具有约束力，用人单位与劳动者应当履行劳动合同约定的义务。同时，根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
法定扣减情形：
- 除了合同或规章制度中的约定外，法律还规定了一些特定情形下可以扣减工资，如代扣代缴个人所得税、社会保险费等。这些扣减是法定的，不依赖于合同或规章制度的约定。
- 法律依据：根据《中华人民共和国个人所得税法》和《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，用人单位有义务代扣代缴个人所得税和社会保险费。
非法扣减情形：
- 如果用人单位无正当理由扣减农村公益岗的工资，或者扣减的金额、方式等违反了法律法规的强制性规定（如超过法定比例、低于最低工资标准等），则这种扣减是违法的。
- 法律后果：根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十五条，用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：（一）未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的；……（四）解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。
建议：
- 对于农村公益岗人员来说，如果发现自己的工资被非法扣减，首先应当查看劳动合同或相关规章制度，了解扣减工资的具体原因和依据。
- 如果认为扣减工资不合法，可以与用人单位进行沟通协商，要求用人单位说明扣减工资的理由和依据，并要求用人单位纠正违法行为。
- 如果沟通协商无果，可以向当地劳动行政部门投诉举报，或者依法申请劳动仲裁、提起诉讼，维护自己的合法权益。
总结：扣农村公益岗工资是否合法，需根据合同约定、规章制度以及法律法规的强制性规定进行综合判断。如果用人单位无正当理由或违反法律法规规定扣减工资，农村公益岗人员有权依法维护自己的合法权益。如有具体法律问题，可直接向我咨询。