综合计算工时制下，法定节假日上班的时间并不算在法定工时内，且用人单位需支付不低于工资的百分之三百的加班工资。以下是对此问题的详细阐述：

一、法定节假日的法律地位

法定节假日是国家法律规定的全民休息日，具有特殊的法律地位和意义，旨在保障劳动者的休息权益。这些节日不受综合工时制等灵活工作安排制度的影响，劳动者在法定节假日享有法定的休息权利。

二、综合工时制的特点

综合工时制是一种特殊的工作时间安排制度，它允许在一定周期（如周、月、季、年）内总工作时间超过标准工作时间，但要求平均工作时间不超过法定标准。这种制度为用人单位提供了更大的灵活性来安排员工的工作时间，但并不改变法定节假日的适用和工资支付规定。

三、法定节假日在综合工时制下的处理

1. 出勤情况：

   • 在综合工时制下，法定节假日并不计入正常的工作时间内。即使员工在这些节日期间出勤工作，该时间也不应被纳入综合计算周期的正常工作时长中。

2. 工资支付：

   • 劳动者在法定节假日出勤工作的，用人单位应当按照不低于劳动者本人日或小时工资标准的300%支付加班工资。这是法律的明确规定，旨在保障劳动者在特殊时间工作能获得相应的额外补偿。

四、实例说明

假设某企业实行季度综合工时制，员工在该季度内总工作时长未超过法定标准。若员工在国庆节（法定节假日）当天被安排上班，那么：

• 这天的工作时间不计入该季度的综合计算工时内。
• 用人单位需单独按照不低于该员工工资300%的标准支付国庆节当天的加班工资。

五、注意事项

• 各地劳动法规可能存在一定差异，但关于法定节假日的工资支付规定是全国统一的。因此，无论在哪个地区，用人单位在法定节假日安排劳动者工作，都必须按照法律规定支付加班工资。
• 如果用人单位的规章制度或劳动合同中有特别规定，如法定节假日不上班也给予额外补贴或福利，那么应按照该规定执行。但这并不改变法定节假日上班需支付300%加班工资的基本原则。

六、法律后果

如果用人单位未按照法律规定支付法定节假日的加班工资，劳动者有权向当地劳动保障部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位支付应得的加班工资及可能的赔偿金。

综上所述，综合计算工时制并不改变法定节假日的适用和工资支付规定。在综合工时制下，法定节假日仍然独立于灵活工作安排之外，员工享有法定的休息权利。如果用人单位需要安排员工在这些节日期间工作，必须按照法律规定支付加班费，以保障劳动者的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。