结论前置：在刑事案件中，若检察院已决定不起诉，公安机关通常不会继续扣留当事人。但这一结论需根据不起诉的具体类型及案件后续发展综合判断。以下从不同角度详细分析：
一、检察院不起诉决定的类型及法律后果
法定不起诉（绝对不起诉）：
- 情形：依据《刑事诉讼法》第十六条，如情节显著轻微、危害不大，或犯罪已过追诉时效期限等，检察院应作出法定不起诉决定。
- 法律后果：案件从法律层面认定不构成犯罪或不具备追究刑事责任的条件，公安机关应立即释放被扣留的当事人，并终止刑事诉讼程序。
酌定不起诉（相对不起诉）：
- 情形：对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚的情况，检察院可作出酌定不起诉决定。
- 法律后果：公安机关在收到不起诉决定书后，应释放被扣留的当事人，并终止刑事诉讼程序。但需注意，若当事人存在行政违法行为，公安机关仍可依法进行行政处罚。
存疑不起诉（证据不足不起诉）：
- 情形：若检察院认为现有证据不足以证明犯罪嫌疑人犯罪事实清楚，证据确实、充分，会作出存疑不起诉决定。
- 法律后果：公安机关在收到不起诉决定书后，应释放被扣留的当事人。但若后续发现新证据，证明犯罪嫌疑人犯罪事实清楚，证据确实、充分，符合起诉条件的，公安机关可以重新将案件移送人民检察院审查起诉。
二、公安机关对检察院不起诉决定的应对
一般情况：
- 检察院作出不起诉决定后，会公开宣布并制作不起诉决定书，送达被不起诉人、公安机关及受害人。
- 公安机关收到不起诉决定书后，如认为决定无误，通常会立即释放被关押的相关人员，并终止对该案件的进一步调查和追责。
特殊情况（存疑不起诉的后续处理）：
- 若检察院作出的是存疑不起诉决定，公安机关在后续侦查中如发现新的证据，证明犯罪嫌疑人犯罪事实清楚，证据确实、充分，符合起诉条件的，可以重新将案件移送人民检察院审查起诉。此时，公安机关可能再次对当事人采取强制措施，如扣留等。
复议与复核：
- 如公安机关认为检察院的不起诉决定有误，可以要求复议或向上级检察院申请复核。
- 复议或复核期间，不起诉决定的法律效力不受影响，公安机关通常不会继续扣留当事人。但若复议或复核结果改变原不起诉决定，公安机关可能根据新的决定对当事人采取相应措施。
三、行政处罚与刑事处罚的区分
法律性质与目的不同：
- 刑事诉讼旨在追究犯罪嫌疑人的刑事责任；行政处罚则是行政机关对违反行政管理秩序的行为给予的制裁。
- 两者性质、目的和种类均不同，可以并行不悖。
适用条件与程序独立：
- 检察机关的不起诉决定仅针对刑事责任；若行为同时违反行政法规，行政机关仍可依法进行处罚。
- 例如，轻微盗窃行为可能因数额未达标准而不被起诉，但仍可根据《治安管理处罚法》进行罚款或拘留等行政处罚。此时，公安机关在释放当事人后，仍可依法对其进行行政处罚，但这与刑事诉讼中的扣留是不同的法律程序。
四、法律建议
对于当事人：
- 若收到检察院的不起诉决定书，应了解自身权利与义务，积极配合公安机关的工作。
- 如认为不起诉决定有误或公安机关的处理不当，可及时寻求法律帮助，维护自身合法权益。
对于公安机关：
- 在收到检察院的不起诉决定书后，应严格按照法律规定处理案件，及时释放被扣留的当事人。
- 如认为不起诉决定有误或发现新证据，应依法通过复议、复核或重新移送审查起诉等程序处理，不得擅自继续扣留当事人。
法律依据：
- 《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条、第一百七十七条、第一百七十八条
- 《中华人民共和国行政处罚法》第二十九条
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