公司发现员工学历造假后，仍然需要支付员工实际工作期间的工资，但员工可能需承担因学历造假给公司造成的损失或违反服务期约定的责任。以下是对这一问题的详细分析：
一、工资支付原则
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条及《中华人民共和国劳动合同法》第二十八条，只要劳动者为用人单位提供了劳动，无论劳动合同是否有效或后续是否被解除，用人单位都应支付相应的劳动报酬。劳动报酬的数额可参照本单位相同或相近岗位劳动者的报酬确定。这意味着，即使员工学历造假，只要其实际为公司提供了劳动，公司就有义务支付其工资。
二、学历造假的影响与后果
劳动合同无效或解除：
- 学历造假属于欺诈行为，根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十六条，以欺诈手段订立的劳动合同无效。
- 同时，根据该法第三十九条，劳动者因欺诈导致劳动合同无效的，用人单位可以解除劳动合同，且无需支付经济补偿。
经济损失赔偿：
- 若员工的学历造假行为给公司造成了经济损失，公司有权依据《工资支付暂行规定》第十六条从员工工资中扣除赔偿金额。但每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
服务期违约金：
- 如公司与员工在劳动合同或其他协议中约定了服务期，并提供了专项培训费用等，员工因学历造假违反服务期约定时，需按约定支付违约金。该违约金可从工资中扣除，但同样需遵守上述扣除限额的规定。
三、公司不支付工资的应对措施
协商：
- 员工可以首先尝试与公司友好协商，明确指出公司应依法支付工资，并保留好协商记录作为后续维权的证据。
投诉与仲裁：
- 若协商无果，员工可以向劳动行政部门投诉举报，或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在申请仲裁时，员工应提供工作记录、考勤记录、工资条等证据以证明自己的工作情况和应得工资。
诉讼：
- 对仲裁结果不满意时，员工可在规定时间内向人民法院提起诉讼，通过司法途径维护自己的合法权益。
四、实际案例与启示
- 在实际案例中，法院通常会判决公司支付员工实际工作期间的工资，即使劳动合同因学历造假被认定无效或被解除。同时，法院也会根据具体情况判决员工是否需承担经济损失赔偿或服务期违约金等责任。
- 这启示我们，学历造假虽属不当行为，但不影响劳动者对已付出劳动获得报酬的权利。然而，劳动者也需承担因其不当行为可能带来的法律后果。
五、建议与总结
- 对于员工：应诚实守信地提供个人信息和学历证明，避免学历造假等不当行为。一旦被发现学历造假，不仅可能面临劳动合同无效或解除的风险，还可能需承担经济损失赔偿或服务期违约金等责任。
- 对于公司：在招聘过程中应加强学历审核等背景调查工作，避免招聘到学历造假的员工。同时，在处理学历造假问题时，应遵守法律法规的规定，不得无故克扣或拖欠员工的工资。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。