结论：加班费能否追回，关键在于能否提供证明加班事实及公司未支付加班费的证据。即使大部分证据在公司，您仍有机会通过合法途径收集和补充证据来追回加班费。
详细分析：
证据的重要性：
- 在劳动纠纷中，证据是维护自身权益的关键。对于加班费的问题，您需要证明存在加班事实以及公司未支付相应的加班费。
- 证据可以包括加班记录、考勤表、工资条、同事证言、电子邮件或聊天记录等，这些都能作为证明加班和未支付加班费的直接或间接证据。
证据在公司的情况：
- 如果大部分证据，如考勤记录、工资条等，都保存在公司，这并不意味着您无法追回加班费。
- 您有权要求公司提供这些证据。根据《劳动争议调解仲裁法》的相关规定，发生劳动争议时，当事人对自己提出的主张有责任提供证据。与争议事项有关的证据属于用人单位掌握管理的，用人单位应当提供；用人单位不提供的，应当承担不利后果。
如何收集和补充证据：
- 与公司协商：首先，您可以尝试与公司协商，要求公司提供相关的考勤记录和工资条等证据。在协商过程中，保持冷静和理性，明确表达您的诉求和理由。
- 申请劳动仲裁：如果协商无果，您可以向当地的劳动仲裁机构申请劳动仲裁。在申请仲裁时，您需要提交仲裁申请书、身份证明以及相关证据材料。即使部分证据在公司，您也可以提供其他能够证明加班事实的证据，如同事证言、电子邮件等。
- 寻求法律援助：如果您在收集证据或申请仲裁过程中遇到困难，可以寻求法律援助或咨询专业律师。律师可以帮助您分析案情，提供法律建议，并协助您收集和整理证据。
加班费的计算：
- 加班费的计算通常根据加班时间和加班工资基数来确定。根据《劳动法》的规定，工作日加班的工资不低于工资的百分之一百五十；休息日加班又不能安排补休的，工资不低于工资的百分之二百；法定休假日加班的，工资不低于工资的百分之三百。
- 具体的计算公式为：加班费 = 加班工资基数 × 加班时间 × 加班费率。其中，加班工资基数通常为您的基本工资，加班时间根据实际加班时长确定，加班费率根据加班类型（工作日、休息日、法定休假日）确定。
建议与行动：
- 尽快行动：如果您认为公司未支付加班费，应尽快采取行动，以免超过劳动仲裁的时效期限。
- 保留证据：在采取任何行动之前，尽量收集和保留所有可能的证据，包括加班记录、考勤表、工资条等。
- 咨询律师：如果您在收集证据或申请仲裁过程中遇到困难，或者对法律程序不熟悉，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。
最后，追回加班费需要一定的时间和努力，但只要您能够提供足够的证据来证明加班事实和公司未支付加班费，您就有机会维护自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。