结论：国企部门负责人动手打员工，纪委是否可以立案办理，需根据具体情况判断。若该行为涉嫌违反党纪，纪委可以立案；若涉嫌违法犯罪，则需由公安机关等司法机关处理，但纪委可依规进行党纪处分或提出处理建议。
分析说明：
纪委的职责与立案范围：
- 纪委主要负责党内监督，对党员的违纪行为进行查处。国企部门负责人若为党员，其动手打员工的行为若涉嫌违反党纪（如违反党的纪律中的“廉洁纪律”或“群众纪律”等，具体需根据行为性质判断），纪委有权进行立案调查。
- 立案的条件通常包括：有证据证明存在违纪行为、违纪行为情节较重或造成不良影响等。
动手打员工行为的法律性质：
- 动手打员工可能构成《治安管理处罚法》中的“殴打他人”或“故意伤害”行为，若情节严重，还可能触犯《刑法》中的“故意伤害罪”。
- 若该行为不构成犯罪，但违反了治安管理规定，公安机关将依法进行处罚；若构成犯罪，则由司法机关依法追究刑事责任。
纪委与司法机关的协作：
- 在国企部门负责人动手打员工的情况下，若纪委在调查过程中发现该行为涉嫌违法犯罪，会将案件移送至公安机关等司法机关处理。
- 同时，纪委也会根据党员的违纪情况，依规进行党纪处分，如警告、严重警告、撤销党内职务、留党察看或开除党籍等。
特殊场景：
- 若国企部门负责人不是党员，纪委则无法直接对其进行党纪立案。但若该行为发生在国企内部，且违反了国企的规章制度或相关法律法规，国企内部的管理机构或相关部门（如人力资源部、法务部等）可能会依据内部规定或法律法规进行处理。
- 若动手打员工的行为同时涉及民事赔偿问题（如员工因被打而遭受身体伤害或财产损失），员工还可以通过民事诉讼途径要求赔偿。
行动建议：
- 对于被打员工而言，应首先确保自身安全，并及时报警或向国企内部的管理机构报告。
- 若涉及党纪处分问题，员工或相关知情人士可以向纪委举报，并提供相关证据材料。
- 在整个过程中，建议员工保留好相关证据（如医疗记录、现场照片、视频等），以便后续维权或处理。
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