结论：怀孕保胎期间，公司扣工资和年终奖通常是不合法的，但需根据具体情况进行判断。

详细分析：

1. 关于扣工资：

   • 法律依据：根据《女职工劳动保护特别规定》第五条，用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳而降低其工资。这意味着，在怀孕保胎期间，女职工的工资应保持不变，公司无权扣减。
   • 特殊情况：如果女职工因请假等原因确实未提供正常劳动，且公司规章制度或劳动合同中有明确规定请假期间的工资支付标准，那么公司可以按照规定支付部分工资或无工资。但这种情况下的扣减必须合法合理，且不得违反法律法规的强制性规定。

2. 关于扣年终奖：

   • 劳动合同与规章制度：年终奖的发放通常受劳动合同和公司规章制度的约束。如果劳动合同或规章制度中明确规定了年终奖的发放条件和标准，且女职工满足了这些条件，那么公司无故扣发年终奖即构成违约。
   • 法律平等保护原则：年终奖作为工资的一部分，无故扣发实际上降低了孕妇的工资，违反了《女职工劳动保护特别规定》中关于不得因女职工怀孕而降低工资的规定，侵害了女职工的平等就业权和劳动报酬权。
   • 特殊情况：如果年终奖的发放与企业经营效益、个人业绩紧密挂钩，且女职工因请假等原因确实影响了工作业绩，同时公司的考核标准和程序合法合理并已明确告知员工，那么根据实际情况适当调整年终奖发放金额可能具有一定合理性。但这种调整必须公平公正，不能构成对孕妇的歧视。

法律建议：

• 协商：如果公司扣发了工资或年终奖，女职工首先应与公司进行协商，尝试通过沟通解决问题。
• 投诉：协商不成时，可以向当地劳动监察部门投诉，请求介入调查并处理。
• 仲裁或诉讼：若投诉无果，女职工还可以向劳动仲裁委员会申请仲裁，甚至依法提起诉讼，以维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果公司被认定违法扣发工资或年终奖，可能需要补发工资或年终奖，并可能面临劳动监察部门的处罚。
• 女职工如果通过法律途径维权成功，还可能获得相应的经济补偿或赔偿。

举例说明：

假设某女职工在怀孕保胎期间，公司以其未提供正常劳动为由扣发了部分工资和年终奖。如果该女职工的劳动合同或公司规章制度中并未规定怀孕保胎期间可以扣发工资或年终奖，且该女职工并未违反公司规章制度或劳动合同中的其他规定，那么公司的行为就构成了违法。该女职工可以通过协商、投诉、仲裁或诉讼等途径来维护自己的合法权益。

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