关于私人渔船船员发生伤残超过三年雇主承担多少责任的问题，这并非一个可以直接给出固定比例或金额的简单答案，而是需要根据具体情况进行综合分析。以下是我从不同角度为你提供的详细解答：

1. 法律关系与责任基础：

   • 首先，需要明确的是，雇主对船员的责任主要基于雇佣关系或劳动关系。在雇佣关系中，雇主有义务提供安全的工作环境，并采取必要的措施防止事故发生。如果船员在雇佣活动中因雇主的原因（如安全措施不到位、操作不当等）导致伤残，雇主应承担相应的赔偿责任。
   • 赔偿责任的范围通常包括医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金等。这些费用的具体数额会根据伤残程度、医疗费用支出、收入水平等因素进行确定。

2. 诉讼时效问题：

   • 关于“超过三年”这一点，需要特别注意的是诉讼时效的问题。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，一般民事权利的诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
   • 如果船员在伤残发生后三年内没有向雇主主张权利，且没有诉讼时效中断、中止等法定情形，那么超过三年后，船员可能面临丧失胜诉权的风险。但这并不意味着雇主完全不承担责任，而是船员可能无法通过法律途径强制雇主赔偿。
   • 然而，如果船员在三年内已经向雇主主张了权利，或者存在诉讼时效中断、中止等情形，那么诉讼时效可能会重新计算或延长。

3. 雇主责任的具体分析：

   • 如果船员在伤残发生后及时主张了权利，且诉讼时效未过期，那么雇主的责任将根据伤残程度、雇主过错程度等因素进行确定。
   • 例如，如果伤残是由于雇主的安全措施不到位导致的，且伤残程度较重，那么雇主可能需要承担较高的赔偿责任。反之，如果伤残部分是由于船员自身过错导致的，那么雇主的责任可能会相应减轻。

4. 实际操作建议：

   • 对于船员来说，如果发生伤残，应尽快向雇主主张权利，并保留好相关证据（如医疗记录、事故报告等）。
   • 如果与雇主协商无果，可以考虑通过法律途径解决纠纷。在提起诉讼前，建议咨询专业律师以评估案件胜诉的可能性和赔偿金额。
   • 对于雇主来说，应加强安全管理，提供必要的安全培训和防护措施，以减少事故发生的可能性。同时，在事故发生后，应积极与船员协商解决纠纷，避免法律风险的扩大。

总结来说，私人渔船船员发生伤残超过三年雇主承担多少责任，并没有一个固定的答案。它取决于多种因素，包括法律关系、诉讼时效、伤残程度、雇主过错程度等。因此，如果你或你身边的人遇到了类似的问题，建议直接向我咨询，我会根据具体情况为你提供详细的法律分析和建议。