关于农村自建房是否必须由建筑公司施工的问题，结论是：我国现行法律并未强制要求农村自建房必须由建筑公司施工，但存在一定限制条件，具体需结合房屋规模、层数及地方性规定综合判断。以下从法律规范、实务操作及风险提示三个角度展开分析：

一、法律规范层面：未强制要求建筑公司施工，但存在例外情形

根据《建筑法》第八十三条第三款规定：“抢险救灾及其他临时性房屋建筑和农民自建低层住宅的建筑活动，不适用本法”。此处“农民自建低层住宅”通常指三层及以下、建筑面积300平方米以内的农村房屋（部分省份如浙江、广东在地方性法规中明确此标准）。若房屋符合该标准，业主可自行组织施工或委托个体工匠施工，无需强制委托建筑公司。

但需注意以下例外：

1. 房屋规模超出低层住宅标准：若房屋层数超过三层或建筑面积超过300平方米，则需适用《建筑法》，必须委托具有相应资质的建筑公司施工，否则可能面临行政处罚（如《建设工程质量管理条例》第六十五条规定，未取得施工许可证擅自施工的，可处工程合同价款1%-2%的罚款）。
2. 地方性法规的特殊要求：部分省份可能对农村自建房施工主体提出更严格规定。例如，江苏省《农村宅基地和住房建设管理办法（试行）》要求，两层及以上农村住房需委托具有资质的建筑企业施工，即使未达到《建筑法》中的“建设工程”标准，也需遵守地方性规定。

二、实务操作层面：自行施工或委托个体工匠的风险与建议

若房屋符合低层住宅标准，业主可选择自行施工或委托个体工匠，但需注意以下风险：

1. 质量与安全风险：自行施工或委托无资质工匠可能导致房屋结构安全隐患（如承重墙设计不合理、钢筋配比不足等），一旦发生坍塌事故，业主需承担主要责任（《民法典》第一千二百五十二条）。
2. 邻里纠纷风险：施工过程中若因噪音、粉尘、占用公共空间等问题与邻居产生纠纷，业主可能需承担侵权责任（《民法典》第二百八十八条）。

建议：

• 即使自行施工，也应参考《农村住房建设技术政策（试行）》等规范，确保房屋结构安全；
• 委托个体工匠时，应签订书面合同，明确工期、质量标准及违约责任，并要求工匠提供身份证明及施工经验证明；
• 施工前向村委会或乡镇政府报备，避免因未报备被认定为“违法建设”。

三、风险提示：未委托建筑公司的法律后果

若房屋规模超出低层住宅标准或地方性法规要求，但业主未委托建筑公司施工，可能面临以下后果：

1. 行政处罚：住建部门可责令停工、限期改正，并处罚款；
2. 房屋无法确权：部分地区规定，未取得施工许可的房屋无法办理房产证；
3. 保险理赔受限：若房屋因质量问题导致损失，保险公司可能以“未合规施工”为由拒绝赔付。

总结：农村自建房是否需建筑公司施工，需结合房屋规模、层数及地方性规定判断。若符合低层住宅标准且无地方特殊要求，可自行施工或委托个体工匠，但需注意质量与安全；若超出标准，则必须委托建筑公司，否则可能面临行政、民事及保险理赔风险。如有具体案件或地方性规定需进一步分析，可直接向我咨询。