企业负责人若含冤入狱，其赔偿问题主要依据《中华人民共和国国家赔偿法》的相关规定来处理，赔偿方式及标准如下：

1. 赔偿请求的提出：

   • 企业负责人在被确认无罪并释放后，有权向作出错误判决或决定的机关（通常是法院或检察院）提出国家赔偿请求。
   • 赔偿请求应当以书面形式提出，并附上相关证明材料，如无罪判决书、释放证明等。

2. 赔偿范围及标准：

   • 人身自由赔偿：根据《国家赔偿法》第三十三条，侵犯公民人身自由的，每日赔偿金按照国家上年度职工日平均工资计算。这意味着，企业负责人因冤案被羁押的每一天，都将按照这一标准获得赔偿。
   • 精神损害赔偿：若冤案给企业负责人造成了严重的精神损害，如名誉受损、家庭破裂等，还可以根据《国家赔偿法》第三十五条，要求支付相应的精神损害抚慰金。精神损害抚慰金的具体数额，会根据损害程度、侵权情节及当地经济水平等因素综合确定。
   • 其他损失赔偿：如果因冤案导致了其他直接经济损失，如企业运营中断造成的损失、个人财产被错误查封或扣押的损失等，也可以依法提出赔偿请求。但这类赔偿通常需要提供充分的证据来证明损失的存在及数额。

3. 赔偿程序：

   • 赔偿义务机关（作出错误判决或决定的机关）在收到赔偿请求后，会进行审查，并在规定期限内作出赔偿决定。
   • 如果赔偿请求人对赔偿决定不服，可以向其上一级机关申请复议，或者直接向人民法院赔偿委员会申请作出赔偿决定。
   • 人民法院赔偿委员会作出的赔偿决定是终局决定，具有法律效力，赔偿义务机关必须履行。

4. 实际操作中的注意事项：

   • 及时提出赔偿请求：企业负责人在被确认无罪后，应尽快提出赔偿请求，以免超过法定的赔偿请求时效。
   • 保留好相关证据：在提出赔偿请求时，应提供充分的证据来证明自己的损失及数额，以便赔偿义务机关能够准确、公正地作出赔偿决定。
   • 寻求专业帮助：由于国家赔偿程序相对复杂，且涉及法律专业知识，建议企业负责人在提出赔偿请求前，咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到充分保障。

总结来说，企业负责人若含冤入狱，其赔偿问题主要依据《国家赔偿法》的相关规定来处理。在提出赔偿请求时，应明确赔偿范围及标准，遵循赔偿程序，并保留好相关证据。如有需要，可随时向我咨询相关法律问题。