结论：单位将应退还的社保公积金直接打入工资账户的行为，是否合法需分情况讨论，关键在于是否符合社保公积金的法定退还程序及工资支付规范。

1. 若单位代扣代缴的社保公积金存在多缴、误缴，需退还至个人账户时，直接打入工资账户可能不合法
   根据《社会保险法》第六十条、《住房公积金管理条例》第十九条，单位有义务按照法定比例代扣代缴社保公积金，且需将个人缴纳部分足额缴存至社保/公积金专户。若因计算错误、重复缴纳等原因需退还，正确的流程是：单位向社保/公积金管理中心申请退费，由管理中心将款项直接退还至个人社保/公积金账户，而非通过工资发放。
   风险点：若单位擅自将退还款打入工资，可能被认定为“未依法缴存公积金”或“克扣工资”（若退还款被抵扣其他费用），个人可向社保/公积金中心投诉或申请劳动仲裁。

2. 若单位将应发工资与社保公积金退还款合并发放，且总额不低于最低工资标准，可能合法但需谨慎操作
   若单位因经营困难等特殊原因，需将社保公积金退还款与当月工资一并发放（例如：单位已垫付个人应缴部分，现需从工资中扣回并退还至个人），需满足以下条件：

   • 明确告知员工：退还款的性质、金额及发放方式需通过书面通知或劳动合同约定，避免员工误解为“克扣工资”；
     
   • 保障实发工资合法：合并发放后的工资总额不得低于当地最低工资标准，且不得违反工资支付周期（如按月支付）；
     
   • 符合财务规范：单位需在财务账目中清晰区分工资与退还款，避免税务或审计风险。
     例外情形：若退还款涉及单位应缴部分（如单位多缴的公积金），单位无权直接扣回，需通过社保/公积金中心办理退费。

3. 建议操作：单位应优先通过法定渠道退还，个人需核对账目

   • 对单位：若需退还社保公积金，应向社保/公积金中心提交《退费申请表》、缴费凭证等材料，由管理中心审核后直接退还至个人账户；若涉及工资调整，需与员工协商一致并留存书面记录。
     
   • 对个人：收到工资后，需核对社保/公积金缴费记录（可通过当地人社局APP或公积金官网查询），确认单位是否已依法缴存。若发现单位未缴存或退还款未到账，可要求单位提供退费凭证，或向社保/公积金中心举报。

总结：单位直接将社保公积金退还款打入工资账户的行为，存在合规风险，尤其是未通过社保/公积金中心退还时。若您遇到此类情况，建议先与单位沟通确认退还原因及流程，必要时可向我进一步咨询具体操作细节。