结论：纪委是否应该采纳相关证据（包括被威胁职工的证言及作证情况），需结合证据的合法性、真实性、关联性以及纪委的调查程序综合判断。以下从法律框架、证据规则、纪委调查程序三个角度展开分析：
一、法律框架：纪委调查的职权依据
根据《中国共产党纪律检查机关监督执纪工作规则》及《中华人民共和国监察法》相关规定，纪委（监察机关）在调查违纪违法案件时，有权依法收集、审查证据，包括证人证言、物证、书证等。证据的采纳需满足“三性”要求：
- 合法性：证据收集程序需合法，例如证人证言需通过询问笔录、录音录像等方式固定，且不得采用威胁、引诱、欺骗等非法手段获取；
- 真实性：证据内容需真实反映案件事实，例如证人需具备认知能力、记忆能力，且证言与其他证据能相互印证；
- 关联性：证据需与案件事实直接相关，例如被威胁职工的证言需能证明院长存在威胁行为，且该行为与案件核心问题（如滥用职权、打击报复等）存在逻辑联系。
若被威胁职工的证言及作证情况符合上述要求，纪委原则上应予以采纳；若证据存在非法取证、内容虚假或与案件无关等情形，则可能被排除。
二、证据规则：证人证言的审查要点
在劳动工伤纠纷中，若院长被指控威胁职工（例如阻止职工申请工伤认定、报复举报人等），纪委需重点审查以下内容：
- 证人资格：作证职工需为案件知情人，且具备完全民事行为能力（如年满18周岁、精神正常）；
- 证言内容：需明确描述威胁的时间、地点、方式（如言语威胁、肢体动作）、具体内容（如“若申请工伤就开除你”）及后果（如职工因恐惧未申请工伤）；
- 证据形式：证人证言需以书面笔录或录音录像形式固定，并由证人签字确认；若证人拒绝作证，纪委可依法强制其配合（但需符合法定程序）；
- 补强证据：若证言为孤证（无其他证据佐证），纪委可能要求提供其他证据（如聊天记录、录音、其他职工的证言）形成证据链。
若10名职工的证言能相互印证，且与其他证据（如医院诊断记录、工伤申请材料）形成完整链条，纪委采纳的可能性较高；反之，若证言存在矛盾或缺乏佐证，可能被质疑真实性。
三、纪委调查程序：证据采纳的流程保障
纪委调查需遵循法定程序，确保证据采纳的公正性：
- 初步核实：纪委收到举报后，需在规定期限内（通常为3个月）完成初步核实，判断是否存在违纪违法事实；
- 立案审查：若初步核实属实，纪委将立案审查，并依法收集证据（包括证人证言）；
- 证据审查：调查组需对证据的“三性”进行审查，必要时可委托鉴定机构对证据真实性进行鉴定（如笔迹鉴定、录音鉴定）；
- 集体讨论：证据审查通过后，需经纪委常委会集体讨论决定是否采纳，并形成调查报告；
- 处分或移送：若证据充分，纪委将根据情节轻重给予党纪政务处分，或移送司法机关处理。
若纪委在调查中未依法履行上述程序（如未固定证言、未审查证据合法性），被调查人（院长）有权提出异议，要求重新调查或申请复议。
四、实务建议：职工如何维护权益？
若您是被威胁职工或相关方，可采取以下措施：
- 保留证据：及时保存威胁相关的聊天记录、录音、邮件等，并尽快向纪委或上级单位举报；
- 配合调查：如实向纪委提供证言，并签署询问笔录前仔细核对内容；
- 申请保护：若担心报复，可向纪委申请保护措施（如不公开个人信息、调整工作岗位）；
- 法律救济：若纪委未依法处理，可向其上级机关申诉，或通过行政诉讼、民事诉讼等途径维权。
纪委调查是严肃的法律程序，证据采纳需严格遵循法律规则。若您有具体证据或案件细节，可进一步向我咨询，我将结合实际情况为您分析。