结论：劳动争议仲裁以超过时效为由不予受理是否合法，需分阶段来看。在受理阶段，仲裁委员会一般不会仅因超过仲裁时效而直接决定不予受理；但在实体审理阶段，若被申请人提出时效抗辩且不存在时效中断、中止等法定情形，仲裁庭将驳回申请人的仲裁请求。因此，超过仲裁时效并不必然导致仲裁委员会直接不予受理仲裁申请，但可能影响仲裁结果。
一、仲裁时效的法律规定与重要性
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，自当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。这一规定旨在促使劳动者及时行使权利，维护劳动关系的稳定和和谐。仲裁时效是保障劳动者权益的重要时间限制，劳动者应予以重视。
二、超过仲裁时效的程序处理
受理阶段：
- 劳动争议仲裁委员会在收到仲裁申请后五日内，如认为符合受理条件，应当受理并通知申请人。在此阶段，仲裁委员会一般不会仅因超过仲裁时效而直接决定不予受理。这是因为仲裁委员会在受理阶段主要审查的是申请的形式要件，如是否属于劳动争议、是否属于本仲裁委员会管辖范围等，而不会深入审查实体问题，包括时效问题。
实体审理阶段：
- 若被申请人以超过仲裁时效进行抗辩，且不存在时效中断、中止等法定情形，仲裁庭将驳回申请人的仲裁请求。这是因为仲裁时效是实体法上的规定，仲裁庭在审理实体争议时，需要审查时效问题，以确定申请人的权利是否仍然受到法律保护。
- 若被申请人未提出时效抗辩，仲裁庭通常不会主动适用仲裁时效规定进行审查并作出不利于申请人的裁决。这是因为仲裁庭遵循“不告不理”的原则，即被申请人未提出抗辩的，仲裁庭不会主动介入。
三、特殊情况下的仲裁时效
- 时效中断或中止：在某些特殊情况下，如因不可抗力或其他正当理由，仲裁时效可能发生中断或中止。例如，劳动者因患病住院治疗，无法及时申请仲裁的，时效可以中止；待劳动者康复后，时效继续计算。劳动者在时效恢复后仍可申请仲裁。
- 劳动报酬争议：劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受一年时效期间的限制；但劳动关系终止后，仍需在一年内提出仲裁申请。这一规定体现了对劳动者劳动报酬权益的特殊保护。
四、超过仲裁时效的后果与建议
后果：
- 仲裁委员会可能驳回请求：在实体审理阶段，若被申请人提出时效抗辩且仲裁庭认定确实超过时效，将驳回申请人的仲裁请求。这意味着劳动者将失去通过仲裁获得裁决的权利。
- 法院受理可能性较小：超过仲裁时效后向法院提起诉讼，法院通常也会以时效已过为由不予受理（但需注意，若仲裁委员会未受理且未说明理由，或申请人对仲裁裁决不服的，仍可向法院提起诉讼）。因此，劳动者应尽量在仲裁时效内提出申请。
建议：
- 及时行使权利：劳动者在面临劳动争议时，应尽快了解并行使自己的权利，确保在仲裁时效内提出仲裁申请。不要拖延时间，以免错过维权时机。
- 增强法律意识：了解劳动法律法规和仲裁时效的相关规定，以便在权益受到侵害时能够及时、有效地维护自己的权益。可以通过阅读相关法律书籍、咨询专业人士或参加法律培训等方式提高自己的法律意识。
- 保留证据材料：在劳动争议发生后，劳动者应尽可能保留与争议相关的证据材料，如劳动合同、工资单、工作证等。这些证据材料在仲裁或诉讼过程中将起到至关重要的作用。
- 寻求专业帮助：如果因特殊原因错过仲裁时效，或者对仲裁程序、实体问题不熟悉的，可以向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。
综上所述，虽然超过仲裁时效并不必然导致仲裁委员会直接不予受理仲裁申请，但在实际审理中，时效问题仍是影响仲裁结果的重要因素。因此，劳动者应严格遵守仲裁时效的规定，及时行使自己的权利，以维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。