作为拥有多领域法律实务经验的律师，针对“老板跑了财务负责人如何处理”这一问题，我的分析和建议如下：

1. 立即核实公司财务状况与法律责任边界
   作为财务负责人，首要任务是梳理公司账目、资金流向及债务情况，确认是否存在违规操作（如抽逃资金、虚假报表等）。若自身未参与违法行为，需留存审计报告、审批流程等证据，证明履职合规性。若发现老板存在挪用资金、逃税等行为，应立即向公安机关经侦部门报案，避免被认定为共犯。

2. 分类应对不同法律风险场景

   • 若公司已资不抵债：
     根据《企业破产法》第15条，财务负责人有义务配合法院及管理人工作，提交财务资料。若拒不配合，可能面临罚款；若存在隐匿财产行为，可能被追究刑事责任。此时应主动向法院申报债权，并说明自身无过错情况。
     
   • 若老板涉嫌刑事犯罪：
     如集资诈骗、非法吸收公众存款等，财务负责人若未参与核心犯罪环节（如仅执行常规财务工作），可向办案机关提交工作记录、审批文件等证明材料，争取免于刑事追责。但若存在协助伪造账目、转移资产等行为，则可能构成共犯。
     
   • 若公司仍存续但老板失联：
     建议立即召开股东会（若可能），按照公司章程选举新负责人，并办理工商变更登记。同时向税务、银行等部门报备老板失联情况，避免因未及时申报导致自身承担连带责任。

3. 主动采取风险隔离措施

   • 书面声明：向公司、股东及监管部门发送书面函件，说明老板失联情况及自身已采取的应对措施，保留邮寄凭证。
     
   • 证据固定：对关键财务资料（如银行流水、合同、审批单）进行公证或电子存证，防止被篡改或销毁。
     
   • 限制权限：若仍持有公司财务账户权限，应立即修改密码并通知银行冻结非必要支出，避免被认定为擅自处置公司财产。

4. 关注自身劳动权益保护
   若老板失联导致公司停业，财务负责人可依据《劳动合同法》第38条，以“未及时足额支付劳动报酬”为由解除劳动合同，并要求公司支付经济补偿。同时，向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，主张工资、社保等权益。

特别提醒：财务负责人的法律责任具有特殊性，即使未直接参与违法活动，也可能因“怠于履职”承担行政或刑事责任。建议根据具体情形，携带相关材料与我进一步沟通，我将结合证据链为您制定针对性应对方案。