关于单位工作日加班如何认定调休的问题，这确实是一个涉及劳动法规定和双方协商的重要议题。下面，我将结合相关法律规定和实际情况，为您详细解答。
一、一般情况下的调休认定
在标准工时制下，根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，用人单位在工作日安排劳动者延长工作时间的，应支付不低于工资的150%的工资报酬。这通常意味着，工作日加班应当优先支付加班工资。然而，法律并未完全排除调休的可能性。如果用人单位与劳动者能够协商一致，选择以调休替代加班工资的支付，这也是被允许的。
二、特殊工时制度下的调休认定
综合计算工时工作制：
- 在这种工作制下，某一具体日（或周）的实际工作时间可能超过8小时（或40小时），但综合计算周期内的总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。
- 超过部分视为延长工作时间，应按150%的标准支付工资报酬。通常情况下，此类工作制不直接涉及调休，而是统一核算加班费用。
- 但如果企业与员工有关于调休的特别约定，且该约定不违反法律强制性规定，那么也可以依约定执行调休。
不定时工作制：
- 对于实行不定时工作制的员工，由于工作时间不固定，一般不存在平时工作日加班以及调休的问题。
- 但若用人单位安排员工在法定节假日工作，则必须按照不低于劳动者本人日或小时工资标准的300%支付工资报酬，且不能以调休来替代支付法定节假日的加班工资。
三、调休安排的注意事项
合法约定：
- 用人单位与劳动者在劳动合同或集体合同中，可以有关加班调休的特别约定。只要该约定符合法律规定，劳动者就有权要求用人单位按照约定安排调休。
合理安排：
- 用人单位应当根据实际情况，合理安排调休时间。调休应当在合理的时间内进行，避免长时间拖延导致劳动者的休息权益受损。
权益保障：
- 如果用人单位以调休为由拒绝支付加班工资，或者安排不合理的调休时间，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自身的合法权益。
四、实际操作建议
- 在实际操作中，用人单位和劳动者应充分沟通、协商一致，明确加班和调休的具体安排。
- 用人单位应制定合理的加班和调休政策，确保劳动者的休息权利得到保障。
- 劳动者在签订劳动合同时，应仔细阅读关于加班和调休的条款，确保自己的权益得到充分保障。
综上所述，工作日安排加班后能否调休，需综合考虑工时制度、法律规定及双方约定等多个因素。希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时咨询。