关于申请了公休休假公司不批准是否违法的问题，这需要根据具体情况来判断。以下是从不同角度进行的分析：
一、公休休假的性质与法律规定
公休休假，通常指的是劳动者依法享有的休息日或年休假等休息权益。根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者有权享受休息和休假的权利，用人单位应当保障劳动者的这一权益。然而，具体到公休休假的批准与否，并非一概而论，而是需要根据实际情况和法律规定来综合考量。
二、年休假调休的特殊情况
年休假安排原则：
- 根据《职工带薪年休假条例》的规定，单位应根据生产、工作的具体情况，并考虑职工本人意愿，统筹安排职工年休假。这意味着，年休假的安排并非完全由劳动者自主决定，而是需要用人单位与劳动者共同协商确定。
不批准年休假的合法性：
- 若用人单位因工作需要不能安排职工休年休假，且未经职工本人同意，或者虽经同意但未按照规定支付未休年休假工资报酬的，则属于违法行为。具体来说，单位应按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬。
- 如果用人单位已经与劳动者协商并得到了劳动者的同意，或者因特殊情况（如紧急生产任务、不可抗力等）确实无法安排年休假，且后续按照规定支付了未休年休假的工资报酬，那么不批准年休假则可能是合法的。
三、其他公休休假（如休息日）的调休情况
双方事先约定：
- 若用人单位与劳动者在劳动合同或公司规章制度中明确约定了公休休假（如休息日）的调休相关事宜（如申请流程、批准条件等），当劳动者按照约定提出调休申请且符合条件时，用人单位无正当理由不批准，可能构成对约定的违反，甚至违背诚实信用原则。尽管这种情况不一定直接认定为违法，但劳动者有权依据约定与公司进行沟通或寻求法律途径解决。
未事先约定：
- 在没有明确约定的情况下，用人单位基于生产经营需要，对员工的公休休假调休申请享有一定的审批权。特别是在业务高峰期或关键时期，为了保障正常的生产经营秩序，用人单位不批准员工调休申请是具有一定合理性的。然而，用人单位也应遵循公平合理、诚实信用等原则，不得随意剥夺劳动者的休息休假权利。
四、建议与行动
与公司沟通：
- 首先，建议劳动者与公司进行沟通，了解公司不批准公休休假的具体原因，并尝试协商解决方案。
查阅公司规章制度：
- 劳动者可以查阅公司的规章制度，了解关于公休休假调休的具体规定，以便更好地维护自己的权益。
寻求法律帮助：
- 如果公司无正当理由不批准公休休假，且违反了相关法律法规或公司规章制度，劳动者可以向劳动部门投诉或寻求法律帮助，以维护自己的合法权益。
总结来说，申请了公休休假公司不批准是否违法，取决于具体情况和公司规定。劳动者在提出申请时应了解相关法律法规和公司政策，并与用人单位进行有效沟通；而用人单位在处理调休申请时也应遵循法律法规和诚信原则，确保劳动者的合法权益得到保障。如果您有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。