关于收取合作商回扣5年后是否还能追究的问题，结论是：这取决于多种因素，包括是否超过了法律规定的诉讼时效、是否有足够的证据支持以及回扣行为的性质等。

1. 诉讼时效问题：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，一般的民事纠纷诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。但是，如果涉及刑事犯罪，如非国家工作人员受贿罪，则可能适用更长的追诉时效，具体根据犯罪的法定最高刑来确定。
   • 对于回扣行为，如果构成犯罪，且法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，追诉时效为十年。因此，如果收取回扣的行为构成犯罪，且未超过相应的追诉时效，那么5年后仍然有可能被追究。

2. 证据问题：

   • 无论是否超过诉讼时效，要追究收取回扣的行为，都需要有足够的证据来支持。这包括回扣的支付记录、双方的沟通记录、证人证言等。
   • 如果缺乏足够的证据，即使未超过诉讼时效，也可能难以成功追究。因此，在考虑是否追究时，需要评估现有证据的充分性和可靠性。

3. 回扣行为的性质：

   • 收取回扣可能构成商业贿赂，违反《中华人民共和国反不正当竞争法》等相关法律法规。如果行为严重，还可能构成犯罪，如非国家工作人员受贿罪。
   • 不同的行为性质将决定不同的法律后果和追究方式。因此，在评估是否追究时，需要明确回扣行为的性质及其法律后果。

4. 实际操作建议：

   • 如果您认为收取回扣的行为违法或构成犯罪，且未超过相应的诉讼时效或追诉时效，同时您有足够的证据来支持您的主张，那么您可以考虑向相关部门举报或提起诉讼。
   • 在采取行动前，建议您咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。律师可以根据您的具体情况和证据情况，为您制定合适的法律策略。

总结来说，收取合作商回扣5年后是否还能追究，取决于是否超过了法律规定的诉讼时效或追诉时效、是否有足够的证据支持以及回扣行为的性质等因素。如果您面临此类问题，建议您及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。