结论：司机上班途中发生碰撞是否可罚款，需分情况讨论，主要取决于碰撞责任归属、是否违反公司规章制度或交通法规。以下分情况具体说明：

1. 若碰撞责任在司机本人，且违反交通法规
   若司机在上班途中因自身过错（如闯红灯、超速、酒驾等）导致碰撞，且被交警认定为全责或主责，则可能面临两种处罚：

   • 行政处罚：根据《道路交通安全法》，交警可对司机处以罚款、扣分、暂扣驾照等处罚（如闯红灯罚款200元、记6分）；
     
   • 民事赔偿：司机需向对方赔偿车辆维修费、医疗费等损失（若购买交强险或商业险，可由保险公司承担部分或全部赔偿）。
     关键点：罚款主体是交警，而非公司；公司无权直接对员工处以行政罚款，但可依据内部制度处理。

2. 若碰撞责任在司机，但未违反交通法规（如对方全责）
   若碰撞由对方过错导致（如对方逆行、违规变道等），司机无责，则：

   • 无需承担行政处罚：交警不会对无责方罚款；
     
   • 可能涉及公司内部管理：若司机因碰撞迟到或影响工作，公司可依据规章制度（如考勤制度）进行扣薪、警告等处理，但不得以“罚款”名义直接扣减工资（根据《工资支付暂行规定》，公司仅能代扣法定项目，如社保、个税等）。
     例外：若公司规章制度明确规定“因个人原因导致事故影响工作可扣减绩效”，且该制度经民主程序制定并公示，则可能合法。

3. 若碰撞发生在执行工作任务期间（如送货、接送客户）
   若司机在上班途中是因执行公司任务（如驾驶公司车辆送货）发生碰撞，则属于工伤范畴（根据《工伤保险条例》第14条），此时：

   • 公司需承担工伤责任：包括医疗费、停工留薪期工资等；
     
   • 司机责任由公司追偿：若碰撞因司机故意或重大过失导致，公司可向司机追偿部分损失（需在劳动合同或规章制度中明确约定，且追偿比例需合理）。
     关键点：公司不得直接对司机罚款，但可通过法律途径追偿损失。

建议：

• 若公司以“碰撞”为由罚款，可要求公司出具书面依据（如规章制度条款），并核对是否合法；
  
• 若涉及交通违法，积极配合交警处理，避免行政处罚升级；
  
• 若因碰撞产生纠纷，可保留证据（如事故认定书、公司通知等）以便维权。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律应对方案。