被告否认已过诉讼时效，确实需要承担举证责任。以下从多个角度对此问题进行详细分析：
一、举证责任的基本原则
在民事诉讼中，举证责任通常遵循“谁主张，谁举证”的原则。当被告主张原告的诉讼请求已超过诉讼时效期间时，被告需要提供证据来支持其主张，否则将承担不利后果。
二、举证的具体内容
证明诉讼时效起算时间的证据：
- 被告需要提供合同、协议等书面文件，显示双方约定的权利行使期限或债务履行期限，以证明诉讼时效的起算时间。
- 往来函件、电子邮件、短信记录等也可以作为证据，证明原告知道或应当知道其权利受到侵害的时间点。
证明诉讼时效期间已过的证据：
- 被告需要提供时间戳记录、日历标记、第三方机构出具的证明文件（如公证处公证书）等，证明从权利受侵害之日至起诉之日已超过法定诉讼时效期间。
- 若存在诉讼时效中断的情形（如权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务等），被告还需提供反证材料，证明诉讼时效未发生中断。
其他辅助性证据：
- 证人证言（需符合法定形式要件）、视听资料（需确保真实性和完整性）、电子数据（需通过合法手段取得且未被篡改）等也可以作为辅助性证据。
三、举证责任的法律依据
- 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
- 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉总则编若干问题的解释》第三十五条也明确规定，民法典第一百八十八条第一款规定的三年诉讼时效期间，可以适用民法典有关诉讼时效中止、中断的规定，不适用延长的规定。
四、举证不能的法律后果
如果被告无法提供充分的证据证明原告的诉讼请求已超过诉讼时效期间，那么法院将不会支持被告的主张，原告的诉讼请求可能会得到法院的支持。
五、实际操作建议
- 及时收集证据：被告在接到法院传票或原告起诉状后，应立即开始收集相关证据，确保在举证期限内提交。
- 构建完整的证据链：所有证据应相互印证，形成完整链条，排除合理怀疑。例如，合同约定的付款日期与催款函的发送时间需对应，以证明原告未在时效期内主张权利。
- 配合法庭调查：在庭审过程中，被告应积极配合法庭调查，对原告提出的反驳证据进行质证，说明其不真实性或与本案无关的理由。
总结与建议：被告否认已过诉讼时效时，需要承担举证责任，并提供充分的证据来支持其主张。在实际操作中，被告应及时收集证据、构建完整的证据链，并积极配合法庭调查。如果被告无法提供充分的证据，将可能承担不利后果。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。