结论：当证据真实但不合法时，该证据通常不能被法院采纳作为定案依据。不过，具体处理方式还需根据证据类型、不合法原因及案件具体情况来综合判断。以下从多个角度进行详细分析：
一、证据真实但不合法的一般处理原则
在司法实践中，证据的真实性、合法性和关联性是证据被采纳的三大基本要素。若证据虽然真实，但获取方式或程序不合法，那么该证据通常会被视为非法证据，从而被排除在定案依据之外。这是为了维护司法公正，防止通过非法手段获取证据，侵犯公民的合法权益。
二、不同类型证据的真实性与合法性考量
物证：
- 如果物证本身是真实的，但获取过程中存在违法行为（如非法搜查、扣押等），那么该物证可能因不合法而被排除。
- 然而，在某些特殊情况下，如紧急情况下为了防止证据灭失而采取的紧急措施，可能被视为合法，此时物证可以被采纳。
书证：
- 书证的真实性通常通过内容来体现，但如果书证的获取方式不合法（如通过盗窃、欺诈等手段获取），则该书证可能被排除。
- 如果书证是公开可得的，或者通过合法途径获取，即使内容对一方不利，也可能被采纳。
证人证言：
- 证人证言的真实性取决于证人的感知和记忆能力，以及是否如实陈述。但如果证人的证言是通过非法手段（如威胁、利诱等）获取的，则该证言可能被排除。
- 合法获取的证人证言，即使对一方不利，也可能被采纳。
视听资料、电子数据：
- 这类证据的真实性通常通过技术手段进行验证。但如果获取过程中存在违法行为（如非法窃听、窃录等），则该证据可能被排除。
- 合法获取的视听资料、电子数据，即使内容对一方不利，也可能被采纳。
三、不合法证据的具体处理方式
直接排除：
- 对于严重违反法定程序或侵犯公民合法权益获取的证据，法院通常会直接排除，不作为定案依据。
补正或合理解释：
- 对于某些轻微违法或存在瑕疵的证据，如果能够通过补正或合理解释消除其违法性或瑕疵，那么该证据可能被采纳。
- 例如，证据收集程序存在轻微瑕疵，但能够证明证据的真实性，且该瑕疵不影响证据的合法性，那么该证据可能被采纳。
非法证据排除规则的例外：
- 在某些特殊情况下，如涉及国家安全、公共利益或紧急情况下，非法证据排除规则可能存在例外。
- 但这些例外情况通常受到严格限制，需要法院根据具体情况进行综合判断。
四、建议与注意事项
合法取证：
- 在收集证据时，务必遵守法定程序，确保证据的合法性。避免通过非法手段获取证据，以免证据被排除。
及时咨询律师：
- 如果对证据的合法性存在疑问，或者担心证据可能被排除，建议及时咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供法律意见和帮助。
保留证据原件：
- 在收集证据时，务必保留证据的原件或原始载体。复印件或复制件可能因无法证明其真实性而被排除。
注意证据的关联性：
- 除了真实性和合法性外，证据的关联性也是重要的考量因素。确保收集的证据与案件事实具有直接关联，能够证明待证事实。
如有任何关于证据合法性或司法行政流程的具体问题，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供详细的法律意见和帮助。