在申请劳动仲裁时，被申请人一般应写公司法人，但在特定情况下也可以写公司内部负责人。以下是对这一问题的详细分析：

一、一般原则：写公司法人

1. 法律地位：公司法人是公司的法律代表，具有独立的法律地位。在劳动仲裁中，将公司法人列为被申请人，是符合法律规定的常规做法。
2. 责任承担：公司法人作为公司的代表，有权代表公司参与仲裁活动，并承担相应的法律责任。如果仲裁裁决对公司不利，公司法人将作为责任主体承担相应的法律后果。

二、特定情况：可以写公司内部负责人

1. 授权代表：如果公司内部负责人（如人力资源部门负责人、总经理等）获得了公司的明确授权，可以代表公司参与仲裁活动，那么在这种情况下，也可以将该内部负责人列为被申请人或共同被申请人。但需要注意的是，这种授权应当是明确且具体的，通常需要在仲裁申请书中附上相关授权文件。
2. 实际控制人或主要责任人：在某些特殊情况下，如果公司内部负责人是公司的实际控制人或主要责任人，且其行为直接导致了劳动纠纷的发生，那么为了更有效地维护劳动者的权益，也可以考虑将该内部负责人列为被申请人。但这种情况需要具体分析，并需要充分的证据支持。

三、实际操作建议

1. 优先写公司法人：在不确定是否可以写公司内部负责人的情况下，建议优先将公司法人列为被申请人。这样可以确保仲裁程序的合法性和有效性，避免因被申请人主体不适格而导致的仲裁程序瑕疵。
2. 咨询专业意见：如果劳动者对被申请人主体的选择存在疑问或不确定，可以咨询专业律师或劳动仲裁机构的意见。他们可以根据具体情况提供针对性的建议和指导。
3. 准备充分证据：无论选择将公司法人还是公司内部负责人列为被申请人，都需要准备充分的证据来支持自己的仲裁请求。这些证据可以包括劳动合同、工资单、工作记录、沟通记录等。

四、法律后果

1. 如果被申请人选择不当：可能会导致仲裁程序无法顺利进行或仲裁裁决无法得到有效执行。例如，如果将没有授权的公司内部负责人列为被申请人，而该负责人又拒绝参与仲裁活动，那么仲裁程序可能会因此受阻。
2. 如果证据不足：即使选择了正确的被申请人，如果证据不足或无法证明自己的仲裁请求，那么劳动者也可能会面临败诉的风险。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况提供针对性的建议和指导。